RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W GEX1P25596 615 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SPO23P33757 523 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W RPC25P35718 212 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W COS8P38723 381 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W AKR1P39010 764 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W EXO1P39875 702 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PFK26P40433 827 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W EMW1P42842 904 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PPT1P53043 513 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W VPS9P54787 451 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W GTO3Q04806 366 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YOL107WQ12239 342 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YOP1Q12402 180 aa5.01□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W IMA3P0CW40 589 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W IMA4P0CW41 589 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W ATP11P32453 318 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W GCG1P32656 232 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W POP4P38336 279 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W URA8P38627 578 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W GOS1P38736 223 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W ERR3P42222 437 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W GET1P53192 235 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W ARG7Q04728 441 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CDC123Q05791 360 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W OPI10Q08202 246 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W IMA2Q08295 589 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W RGS2Q99188 309 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SAS5Q99314 248 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W HIS5P07172 385 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W COR1P07256 457 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MNE1P24720 663 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W FIG1P38224 298 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PEX28P38848 579 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W ACA1P39970 489 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W FAU1P40099 211 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MET28P40573 187 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PTK2P47116 818 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SLD3P53135 668 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YTP1P53584 459 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CPR6P53691 371 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W URH1Q04179 340 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MCH5Q08777 521 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YPL150WQ12152 901 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W FRE6Q12473 712 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YOR111WQ99210 232 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MTF1P14908 341 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MRPL44P19956 98 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CCA1P21269 546 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W DCC1P25559 380 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W DBF4P32325 704 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W APN2P38207 520 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CEM1P39525 442 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W THI6P41835 540 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W IRC7P43623 340 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CLA4P48562 842 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MRPL19P53875 158 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W ASI2P53895 289 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SMA1Q02651 245 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YPL080CQ02826 108 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W TRM82Q03774 444 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W HDA2Q06629 674 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CDA1Q06702 301 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W LDB19Q12502 818 aa5□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PDC6P26263 563 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SBA1P28707 216 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YHR078WP38799 552 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CYC2P38909 366 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W PLB1P39105 664 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SEO1P39709 593 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W LSM4P40070 187 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W LSM5P40089 93 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W TIR3P40552 269 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CHS6P40955 746 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W MAD2P40958 196 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YJR030CP47101 745 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W SAM37P50110 327 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YGR017WP53210 297 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YGR117CP53270 476 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YGR122WP53272 402 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YNR065CP53751 1116 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W HCH1P53834 153 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W DIA1P54005 336 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W CTF19Q02732 369 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W AIM32Q04689 311 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W NEJ1Q06148 342 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W ELG1Q12050 791 aa4.99□□□□□ -1.61
CYK3YDL117W YRR1Q12172 810 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.7 ms