RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	SPO23	P33757	523 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ELF1	P36053	145 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	APT2	P36973	181 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SEA4	P38164	1038 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YFL040W	P43562	540 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CIT3	P43635	486 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YJR107W	P47145	328 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ERV14	P53173	138 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	INN1	P53901	409 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CIA1	Q05583	330 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	HDA3	Q06623	655 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ENT4	Q07872	247 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	THI73	Q07904	523 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RBD2	Q12270	262 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MET2	P08465	486 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	LDS1	P31379	325 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	BIO2	P32451	375 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ATP11	P32453	318 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ISC10	P32645	267 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PDR3	P33200	976 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	BMT2	P38278	337 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ERV15	P38312	142 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PRE3	P38624	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	APM2	P38700	605 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ARN1	P38731	627 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NPR2	P39923	615 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	QDR1	P40475	563 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	VPS70	P47161	811 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TOM22	P49334	152 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YGL117W	P53133	265 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ARK1	P53974	638 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TIM44	Q01852	431 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SMA1	Q02651	245 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PEX25	Q02969	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MAK3	Q03503	176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NSL1	Q12143	216 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SCEI	P03882	235 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	DAL81	P21657	970 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ECM25	P32525	599 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PTC1	P35182	281 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	LAG1	P38703	411 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	GEP4	P38812	185 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NSG1	P38837	291 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	FMP52	P40008	231 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PCL6	P40038	420 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	UFE1	P41834	346 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
CLF1	YLR117C	YNR062C	P53748	327 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YNL146W	P53906	100 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	GRX5	Q02784	150 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PML39	Q03760	334 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PHO92	Q06390	306 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	THI3	Q07471	609 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	IMA2	Q08295	589 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RIB3	Q99258	208 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	UBR1	P19812	1950 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TRP3	P00937	484 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	COS2	P0CX12	379 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	COS3	P0CX13	379 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	INO1	P11986	533 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	IST2	P38250	946 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CIN5	P40917	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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