RNA–Protein interactions for RNA: YKL008C

LAC1, Transcript of Ceramide synthase component, yeast

Gene LAC1, Length 1,257 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAC1	YKL008C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	SET6	Q12529	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	PPH22	P23595	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	SPC110	P32380	944 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	MDM31	P38880	579 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	RPH1	P39956	796 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	SHO1	P40073	367 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	YGR149W	P48236	432 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	VPS74	Q06385	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	AYT1	Q12226	474 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	SCM3	Q12334	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	SIN3	P22579	1536 aa		4.16	□□□□□ -1.74
LAC1	YKL008C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	BUB3	P26449	341 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	THI2	P38141	450 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
LAC1	YKL008C	RRD2	Q12461	358 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	ATP10	P18496	279 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	HAT2	P39984	401 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	FAU1	P40099	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	ELP2	P42935	788 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	NUP170	P38181	1502 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	HEM2	P05373	342 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	RHO2	P06781	192 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	PHO2	P07269	559 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	CLB3	P24870	427 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YIM1	P28625	365 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	AGA1	P32323	725 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	NPL6	P32832	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	PMU1	P36069	295 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	BYE1	P36106	594 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	ALG8	P40351	577 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YJL213W	P40896	331 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	GWT1	P47026	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	VTA1	Q06263	330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	SIL1	Q08199	421 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	PPT2	Q12036	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	SFI1	Q12369	946 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	CYB2	P00175	591 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	SPS4	P09937	338 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	FRE2	P36033	711 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	TUL1	P36096	758 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	CBP4	P37267	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	KRE9	P39005	276 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	URB2	P47108	1174 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YDL186W	P48568	277 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	COS10	P52924	374 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	RSM22	P36056	628 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	VTC2	P43585	828 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	SPC19	Q03954	165 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	RTT103	Q05543	409 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	NFU1	P32860	256 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	HCS1	P34243	683 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	WSC2	P53832	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	CTF3	Q12748	733 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	ATR1	P13090	542 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	RML2	P32611	393 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	NIP100	P33420	868 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	PIR3	Q03180	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LAC1	YKL008C	SOV1	Q04748	898 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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