RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W YTA12P40341 825 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YJL068CP40363 299 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W MET28P40573 187 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YJR154WP47181 346 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W ALT2P52892 507 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W PIB2P53191 635 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W RPM2Q02773 1202 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W ERO1Q03103 563 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W FIN1Q03898 291 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W VPS38Q05919 439 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W AVL9Q12500 764 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W LYS2P07702 1392 aa3.49□□□□□ -1.85
THP2YHR167W URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W GAL80P04387 435 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W PDA1P16387 420 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W SEC62P21825 274 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W KRE2P27809 442 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YBL028CP38202 106 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W MUM2P38236 366 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W MSR1P38714 643 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YEH2Q07950 538 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W RIM20Q12033 661 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.48□□□□□ -1.85
THP2YHR167W SUC2P00724 532 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YML002WP0CF17 737 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W APE1P14904 514 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W OCA4P25366 362 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W SIP2P34164 415 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W SHP1P34223 423 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W SPL2P38839 148 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W VPS52P39904 641 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W ESL1P40456 1118 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W CSM2P40465 213 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W SPO22P40511 975 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W EPL1P43572 832 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YFH7P43591 353 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.47□□□□□ -1.85 RIP-Chip
THP2YHR167W IKS1P47042 667 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W PET130P47065 347 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W YGL260WP53056 76 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W TOF2Q02208 771 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W GLO2Q05584 274 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W THP1Q08231 455 aa3.47□□□□□ -1.85
THP2YHR167W ARG3P05150 338 aa3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W TPM1P17536 199 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W MRE11P32829 692 aa3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W MSN2P33748 704 aa3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W CRZ1P53968 678 aa3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W SLD5Q03406 294 aa3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W UBX2Q04228 584 aa3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W BNA5Q05979 453 aa3.46□□□□□ -1.86
THP2YHR167W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W YCR007CP25354 239 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W ATS1P31386 333 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W FRE1P32791 686 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W DUG2P38149 878 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W TCM62P38228 572 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W NDE1P40215 560 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W RMD8P43620 662 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W COG4Q06096 861 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W TIP41Q12199 356 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W YIL177CP40434 1758 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W YJL225CP40889 1758 aa3.45□□□□□ -1.86
THP2YHR167W POM152P39685 1337 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W FOB1O13329 566 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W COR1P07256 457 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W PHO2P07269 559 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W RNR2P09938 399 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W COQ1P18900 473 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W YME1P32795 747 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W BNA4P38169 460 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.44□□□□□ -1.86not detected
THP2YHR167W SHC1P39000 512 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W MET18P40469 1032 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W IRC6P43615 237 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W VPS20Q04272 221 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W IVY1Q04934 453 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W RTT103Q05543 409 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W PHO92Q06390 306 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W SYO1Q07395 620 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.44□□□□□ -1.86
THP2YHR167W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.44□□□□□ -1.86
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