RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	TOP1	P04786	769 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	DAL5	P15365	543 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	PRE8	P23639	250 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RER1	P25560	188 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	POL4	P25615	582 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	TUL1	P36096	758 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YEL068C	P39977	110 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	FAR3	P46671	204 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SPL2	P38839	148 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	LYS14	P40971	790 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YJR154W	P47181	346 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	ADD37	Q03233	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YML037C	Q03703	340 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	GRX6	Q12438	231 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	TOM1	Q03280	3268 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	MRP13	P12686	339 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	ATR1	P13090	542 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YCK1	P23291	538 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	LDB16	P25587	256 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YIH1	P25637	258 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	MRPL4	P36517	319 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YBP1	P38315	674 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YHR210C	P38893	341 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SHC1	P39000	512 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	AFG3	P39925	761 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	HAT2	P39984	401 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SHE10	P53075	577 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	CTF3	Q12748	733 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	POM152	P39685	1337 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SUC2	P00724	532 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PMR1	P13586	950 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	KRE2	P27809	442 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	CIN4	P39110	191 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	ALG8	P40351	577 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	IVY1	Q04934	453 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	COQ9	Q05779	260 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PHO92	Q06390	306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	HNT3	Q08702	217 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	CHS3	P29465	1165 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	IRC15	Q02733	499 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	IRC4	Q03036	179 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RIF1	P29539	1916 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YCR007C	P25354	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	UTR4	P32626	227 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YBL029W	P38201	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YGL242C	P53066	181 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	MEP3	P53390	489 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	UBX2	Q04228	584 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YKU80	Q04437	629 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	UBR2	Q07963	1872 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	ELO2	P25358	347 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	CCT6	P39079	546 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	IPI3	P53877	555 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	NGL3	Q03210	505 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	VPS74	Q06385	345 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	THP1	Q08231	455 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	FAA2	P39518	744 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	GWT1	P47026	490 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEX18	YHR160C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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