RNA–Protein interactions for RNA: YBR229C

ROT2, Transcript of Glucosidase II catalytic subunit, yeast

Gene ROT2, Length 2,865 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROT2	YBR229C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	SFP1	P32432	683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ARN2	P38724	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RPH1	P39956	796 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	DDI1	P40087	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MPM1	P40364	252 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	SYG1	P40528	902 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
ROT2	YBR229C	SMA1	Q02651	245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	VHS1	Q03785	461 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RNH1	Q04740	348 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	COS7	Q07788	383 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	NSI1	Q12457	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	STE3	P06783	470 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	CDC4	P07834	779 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MAS1	P10507	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MET8	P15807	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YCL049C	P25577	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GCS1	P35197	352 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PAN6	P40459	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	AIM23	P47015	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	AIM14	P53109	570 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MGR3	Q04472	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ARR1	Q06596	294 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	SCM3	Q12334	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GPR1	Q12361	961 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	CDC21	P06785	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MNE1	P24720	663 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GIT1	P25346	518 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MEI5	P32489	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GLG1	P36143	616 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	CEM1	P39525	442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	SPO73	P40031	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YFL052W	P43551	465 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	BIT61	P47041	543 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	AIM22	P47051	409 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	SNF12	P53628	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	BSP1	Q06604	576 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	NDD1	Q08887	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	UIP4	Q08926	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GLE1	Q12315	538 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	UBR1	P19812	1950 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PUT2	P07275	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PBS2	P08018	668 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GEX1	P25596	615 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	SDH3	P33421	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GEX2	P36173	615 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YBR071W	P38243	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	EXO1	P39875	702 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	COG3	P40094	801 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	HOC1	P47124	396 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RIM21	P48565	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PIR1	Q03178	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PEX10	Q05568	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	MRX10	Q05648	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RRT8	Q08219	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	BUD7	Q08754	746 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	TGL5	Q12043	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	PST1	Q12355	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ATP4	P05626	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	UNG1	P12887	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	DAL81	P21657	970 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ISF1	P32488	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	UIP5	P36137	443 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	ARA1	P38115	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROT2	YBR229C	GDH3	P39708	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.3 ms