RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	RAV1	P47104	1357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MET5	P47169	1442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	AFG1	P32317	509 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	GYP6	P32806	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	UIP5	P36137	443 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ARA1	P38115	344 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SIF2	P38262	535 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SER3	P40054	469 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	OSW5	P40219	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YIL060W	P40519	144 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	IRC7	P43623	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	UBP8	P50102	471 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	TOF1	P53840	1238 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	DUG3	P53871	357 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SPH1	Q06160	661 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MLH2	Q07980	695 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RHO2	P06781	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	CLN1	P20437	546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	STV1	P37296	890 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ROT2	P38138	954 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	HXT9	P40885	567 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SHE10	P53075	577 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
PRX1	YBL064C	VAM3	Q12241	283 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MDY2	Q12285	212 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SAC3	P46674	1301 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	OM45	P16547	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RPB8	P20436	146 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	GRR1	P24814	1151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RAD51	P25454	400 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MSP1	P28737	362 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	BNA4	P38169	460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YJL132W	P47014	750 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ATP23	P53722	227 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ARP10	Q04549	284 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YLH47	Q06493	454 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SPO7	P18410	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	CNA1	P23287	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	DAL80	P26343	269 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	COQ3	P27680	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	HIR2	P32480	875 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	VPS17	P32913	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	LAG1	P38703	411 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YHR131C	P38835	850 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PHO90	P39535	881 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	NAS2	P40555	220 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	GCD10	P41814	478 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	FET5	P43561	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	AGX1	P43567	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ECM27	P47144	725 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	TOM22	P49334	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PKP2	P53170	491 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SOL4	P53315	255 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SHR3	Q02774	210 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	DCS1	Q06151	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MCP2	Q06567	569 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RDR1	Q08904	546 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MED2	Q12124	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PSY3	Q12318	242 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	FRE7	Q12333	620 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RRI1	Q12468	440 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	EDE1	P34216	1381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	VMR1	P38735	1592 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	QCR6	P00127	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	RIP1	P08067	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRX1	YBL064C	PEP5	P12868	1029 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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