RNA–Protein interactions for RNA: YMR278W

PRM15, Transcript of Phosphoribomutase, yeast

Gene PRM15, Length 1,869 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRM15	YMR278W	MRPL25	P23369	157 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	HMX1	P32339	317 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	NUP133	P36161	1157 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	MMS4	P38257	691 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	GIP4	P39732	760 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	ECM10	P39987	644 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	PHM8	P40025	321 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	IAH1	P41734	238 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	UBC11	P52492	156 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	PRM1	P53835	661 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PRM15	YMR278W	KRE5	P22023	1365 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	FUB1	P25659	250 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	LAC1	P28496	418 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SIP1	P32578	815 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YBR139W	P38109	508 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PEX32	P38292	413 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	CIN1	P40987	1014 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	UBX6	P47049	396 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MUP1	P50276	574 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MPS2	P53159	387 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YGR127W	P53275	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	UBP16	Q02863	499 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MSC1	Q03104	513 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SMA2	Q04658	369 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	COQ9	Q05779	260 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	DCS1	Q06151	350 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MLH3	Q12083	715 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MTR10	Q99189	972 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	USO1	P25386	1790 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SIR3	P06701	978 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SAG1	P20840	650 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PET18	P25362	215 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	HIR2	P32480	875 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PHO11	P35842	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	GLG1	P36143	616 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YBL028C	P38202	106 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PHO12	P38693	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PLB1	P39105	664 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	OPT1	P40897	799 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	NMD5	P46970	1048 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	BUD17	P53727	317 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MFM1	Q02783	413 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SEG1	Q04279	960 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	STE23	Q06010	1027 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	VAM3	Q12241	283 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	LCB4	Q12246	624 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	LAS17	Q12446	633 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	AAC1	P04710	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SPS4	P09937	338 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	UNG1	P12887	359 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	MER1	P16523	270 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SPS22	P25380	463 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	BOS1	P25385	244 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	LHS1	P36016	881 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	TPO5	P36029	618 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	BZZ1	P38822	633 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YFR020W	P43600	232 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YIP5	P53108	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	COQ6	P53318	479 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	RXT3	Q07458	294 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YDL177C	Q12257	170 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	PET111	P08468	800 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	RAD14	P28519	371 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PRM15	YMR278W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84

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