RNA–Protein interactions for RNA: YMR078C

CTF18, Transcript of Subunit of a complex with Ctf8p, yeast

Gene CTF18, Length 2,226 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF18	YMR078C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YCR051W	P25631	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	THI2	P38141	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	MPS1	P54199	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	AFG1	P32317	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	VPS52	P39904	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	CSM2	P40465	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SOV1	Q04748	898 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	GLO2	Q05584	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SIL1	Q08199	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	CDC23	P16522	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YCR007C	P25354	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	MIC60	P36112	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YJL068C	P40363	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
CTF18	YMR078C	ICT1	Q12385	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RAD14	P28519	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	TMT1	P32643	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	VPS17	P32913	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SSU1	P41930	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	FMP42	Q04991	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	ATP10	P18496	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	FRE1	P32791	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SEC5	P89102	971 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	RMT2	Q03305	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	IVY1	Q04934	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	SYO1	Q07395	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF18	YMR078C	MRS3	P10566	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	SEC62	P21825	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	CLB1	P24868	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YME2	P32843	850 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	HCS1	P34243	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	AFI1	Q99222	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	ERV1	P27882	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	DBF4	P32325	704 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YTA12	P40341	825 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	TCB2	P48231	1178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YEH2	Q07950	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	NRT1	Q08485	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	RHO2	P06781	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	SPS4	P09937	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	GEX1	P25596	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	GPI1	P53306	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	CLC1	P17891	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YML6	P51998	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	RIP1	P08067	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	SEC63	P14906	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YCR022C	P25620	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	NIP100	P33420	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	FAU1	P40099	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	AIM32	Q04689	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	BUB3	P26449	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	RIM2	P38127	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	POP1	P41812	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	ISA2	Q12425	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	ATS1	P31386	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	TRS65	P32893	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	PIM1	P36775	1133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	NUP53	Q03790	475 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	MDM30	Q05930	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	YAP7	Q08182	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	REC107	P21651	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	RFC3	P38629	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	BZZ1	P38822	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	ZIM17	P42844	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	COS5	P47187	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	CUL3	P53202	744 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	DON1	Q05610	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	COS7	Q07788	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTF18	YMR078C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64

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