RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C ESS1P22696 170 aa4.94□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C GCD11P32481 527 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C BRL1P38770 471 aa4.94□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C SLY41P22215 453 aa4.93□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C STR2P47164 639 aa4.93□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C ISM1P48526 1002 aa4.93□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C TFB3Q03290 321 aa4.93□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C KTR1P27810 393 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C HST2P53686 357 aa4.92□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C ERF2Q06551 359 aa4.92□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C YNL115CP53925 644 aa4.91□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C HPC2Q01448 625 aa4.91□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C YPR015CQ12531 247 aa4.91□□□□□ -1.62
RPB11YOL005C ARG8P18544 423 aa4.9□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C SIT4P20604 311 aa4.9□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C RAM1P22007 431 aa4.9□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C YJU3P28321 313 aa4.9□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TAF7Q05021 590 aa4.9□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C GYP1Q08484 637 aa4.9□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C PRT1P06103 763 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C PKC1P24583 1151 aa4.88□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C VRP1P37370 817 aa4.88□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C RTF1P53064 558 aa4.88□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TBF1Q02457 562 aa4.88□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C RAD59Q12223 238 aa4.87□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-DR4O74302 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-AP0CX57 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-PR1P0CX58 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-ORP0CX59 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-PR2P0CX60 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-DR5P0CX65 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-ER2P0CX66 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-GR3P0CX67 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-LR1P0CX68 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-MR2P0CX69 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TRM1P15565 570 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C YBL036CP38197 257 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C RRN7P40992 514 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-JR2P47099 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-DR1Q03856 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-BRQ12217 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-NL2Q12470 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TY1A-GR2Q12485 440 aa4.86□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C SEC2P17065 759 aa4.85□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C PAT1P25644 796 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C TUB4P53378 473 aa4.85□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C YJL007CP47080 104 aa4.84□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C PUS6P53294 404 aa4.84□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C LAM6Q08001 693 aa4.84□□□□□ -1.63
RPB11YOL005C BCK2P33306 851 aa4.83□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C YDL206WQ12424 762 aa4.82□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C PAC1P39946 494 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data4.8□□□□□ -1.64not detected
RPB11YOL005C SAS4Q04003 481 aa4.8□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C AGE1Q04412 482 aa4.8□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C BIM1P40013 344 aa4.79□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C KXD1P53158 218 aa4.79□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C ERG12P07277 443 aa4.78□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C RSC30P38781 883 aa4.78□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C ATG32P40458 529 aa4.78□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C YNL108CP53929 270 aa4.78□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C ALR1Q08269 859 aa4.78□□□□□ -1.64
RPB11YOL005C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C BIO2P32451 375 aa4.77□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C CSE4P36012 229 aa4.76□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C RPA14P50106 137 aa4.76□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C RLF2Q12495 606 aa4.76□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C PDC1P06169 563 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C TIF1P10081 395 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C XDJ1P39102 459 aa4.74□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C YPR097WQ06839 1073 aa4.74□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C YPR204WQ08995 1032 aa4.74□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C RTG2P32608 588 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C HXT10P43581 546 aa4.73□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C YEL077CQ3E7X8 1277 aa4.73□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C PUS5Q06244 254 aa4.72□□□□□ -1.65
RPB11YOL005C SDH2P21801 266 aa4.71□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C KIP2P28743 706 aa4.71□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C ISF1P32488 338 aa4.71□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C RRD1P40454 393 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C BDP1P46678 594 aa4.71□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C ENO2P00925 437 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C TEC1P18412 486 aa4.7□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C CST6P40535 587 aa4.7□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C MCM16Q12262 181 aa4.69□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C MOD5P07884 428 aa4.68□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C SUP45P12385 437 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C AMS1P22855 1083 aa4.68□□□□□ -1.66
RPB11YOL005C FIG4P42837 879 aa4.68□□□□□ -1.66
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