RNA–Protein interactions for RNA: YNL233W

BNI4, Transcript of Targeting subunit for Glc7p protein phosphatase, yeast

Gene BNI4, Length 2,679 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BNI4	YNL233W	ALD2	P47771	506 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	DOS2	P54858	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	ERP5	P38819	212 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	SVF1	Q05515	481 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	CSC1	Q06538	782 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	SAM3	Q08986	587 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	GYP5	Q12344	894 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	NNF1	P47149	201 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	ECM23	Q02710	187 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	TOP1	P04786	769 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	SPC42	P36094	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	LAM6	Q08001	693 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BNI4	YNL233W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	SIT4	P20604	311 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	PEP12	P32854	288 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	KTR7	P40504	517 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	POL32	P47110	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	KAR5	Q04746	504 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	UBX7	P38349	436 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	YHL050C	P38721	697 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	YHR219W	P38900	624 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	RSC30	P38781	883 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	TFB4	Q12004	338 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	AI4	P03878	556 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	GAL2	P13181	574 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	PPX1	P38698	397 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	YAF9	P53930	226 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	NST1	P53935	1240 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	SLY41	P22215	453 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	THI12	P42883	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	THI5	P43534	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	THI11	P47183	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	FAR11	P53917	953 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	THI13	Q07748	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	MCM16	Q12262	181 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	ATE1	P16639	503 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	DCW1	P36091	449 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	PEX21	P50091	288 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	ENV9	Q08651	330 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	YGL015C	P33199	130 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	CST6	P40535	587 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	MDJ2	P42834	146 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	MGE1	P38523	228 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	SLI15	P38283	698 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	RTF1	P53064	558 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	ATG1	P53104	897 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	WHI5	Q12416	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BNI4	YNL233W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	HTA2	P04912	132 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	SEC8	P32855	1065 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	YNL115C	P53925	644 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
BNI4	YNL233W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	STB3	Q12427	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	GTT3	P39996	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	ATG3	P40344	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	CDC73	Q06697	393 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	PHO87	P25360	923 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	ISF1	P32488	338 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	PUS6	P53294	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	PNP1	Q05788	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	HAP4	P14064	554 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	EMP47	P43555	445 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	TBF1	Q02457	562 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	YJR107W	P47145	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	RNH70	P53331	553 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	MET1	P36150	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	BOL3	P39724	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	DAN4	P47179	1161 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	NUT2	Q06213	157 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	RTS3	P53289	263 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	SRS2	P12954	1174 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BNI4	YNL233W	PPG1	P32838	368 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.2 ms