RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	PKC1	P24583	1151 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	BIM1	P40013	344 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	MID1	P41821	548 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	ESS1	P22696	170 aa		3.4	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	SIS2	P36024	562 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.39	□□□□□ -1.87	not detected
STB4	YMR019W	YPP1	P46951	817 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	HAP5	Q02516	242 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	PUS6	P53294	404 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	NUD1	P32336	851 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	SCJ1	P25303	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	SAP30	P38429	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	ATG32	P40458	529 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	YJL171C	P46992	396 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	ARH1	P48360	493 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	YPR204W	Q08995	1032 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	SPT23	P35210	1082 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	ATG3	P40344	310 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	YJU3	P28321	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	BNI4	P53858	892 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	YNL108C	P53929	270 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	KEX2	P13134	814 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	GEF1	P37020	779 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	FKH1	P40466	484 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	BIO2	P32451	375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	KXD1	P53158	218 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	ALR1	Q08269	859 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	BMT6	Q12291	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STB4	YMR019W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	RAM1	P22007	431 aa		3.33	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	MRX12	P47084	519 aa		3.33	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	RPA14	P50106	137 aa		3.32	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	ENV9	Q08651	330 aa		3.32	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	PDR1	P12383	1068 aa		3.32	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	TTI1	P36097	1038 aa		3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	RSC30	P38781	883 aa		3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	ISM1	P48526	1002 aa		3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	YDL206W	Q12424	762 aa		3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	CPS1	P27614	576 aa		3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	GUT2	P32191	649 aa		3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	SAS4	Q04003	481 aa		3.31	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	SLD2	P34252	453 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	PRE3	P38624	215 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	GYP1	Q08484	637 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	ERG12	P07277	443 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	TEC1	P18412	486 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	TUB4	P53378	473 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	YPR097W	Q06839	1073 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	STR2	P47164	639 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	MCM16	Q12262	181 aa		3.3	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	RRN7	P40992	514 aa		3.29	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	ERF2	Q06551	359 aa		3.29	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	SLX8	P40072	274 aa		3.28	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	RIM21	P48565	533 aa		3.28	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
STB4	YMR019W	YFL034W	P43564	1073 aa		3.27	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	EMP47	P43555	445 aa		3.26	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	MRX10	Q05648	414 aa		3.26	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TGL4	P36165	910 aa		3.26	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	HXT10	P43581	546 aa		3.26	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	KIP2	P28743	706 aa		3.26	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	KTR7	P40504	517 aa		3.25	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	FRA1	Q07825	749 aa		3.25	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	HAP4	P14064	554 aa		3.25	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TPD3	P31383	635 aa		3.25	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	YML020W	Q03722	664 aa		3.25	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	AGE1	Q04412	482 aa		3.25	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
STB4	YMR019W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms