RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeastyeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS31YLR167W ISU2Q12056 156 aa7.68□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W TTI1P36097 1038 aa7.67□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W YNL115CP53925 644 aa7.67□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W PML39Q03760 334 aa7.67□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W ARG8P18544 423 aa7.66□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W RTG2P32608 588 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W MID1P41821 548 aa7.66□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W YRR1Q12172 810 aa7.66□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W YNL108CP53929 270 aa7.65□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W SPP1Q03012 353 aa7.65□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W YPR204WQ08995 1032 aa7.65□□□□□ -1.18
RPS31YLR167W SLY41P22215 453 aa7.64□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W SEC61P32915 480 aa7.64□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.64□□□□□ -1.19not detected
RPS31YLR167W YML020WQ03722 664 aa7.64□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W SIS2P36024 562 aa7.63□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W CPS1P27614 576 aa7.62□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W SLX8P40072 274 aa7.62□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W NMA111P53920 997 aa7.6□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W PEX29Q03370 554 aa7.6□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W MRX10Q05648 414 aa7.6□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W ENO2P00925 437 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W RTG1P32607 177 aa7.59□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W PUS6P53294 404 aa7.59□□□□□ -1.19
RPS31YLR167W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W NUD1P32336 851 aa7.58□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W YPP1P46951 817 aa7.58□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W RIM21P48565 533 aa7.58□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W ENO1P00924 437 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W LDB19Q12502 818 aa7.57□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W KEX2P13134 814 aa7.56□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W YDL129WQ07555 291 aa7.55□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W PUP1P25043 261 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W NPL4P33755 580 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W ERF2Q06551 359 aa7.53□□□□□ -1.2
RPS31YLR167W CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W PEP12P32854 288 aa7.51□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W TBF1Q02457 562 aa7.51□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W HAP5Q02516 242 aa7.51□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W NCR1Q12200 1170 aa7.51□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W PDR1P12383 1068 aa7.5□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W STR2P47164 639 aa7.5□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W ARH1P48360 493 aa7.5□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W ISM1P48526 1002 aa7.5□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W MCM16Q12262 181 aa7.5□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W TGL4P36165 910 aa7.49□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W YJL171CP46992 396 aa7.49□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W AGE1Q04412 482 aa7.49□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W RDS2P19541 446 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W FKH1P40466 484 aa7.48□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W RPA14P50106 137 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W YML083CQ04526 418 aa7.47□□□□□ -1.21
RPS31YLR167W TUB4P53378 473 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W BNI4P53858 892 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W YDL206WQ12424 762 aa7.46□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-DR4O74302 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-AP0CX57 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-ORP0CX59 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-DR5P0CX65 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-ER2P0CX66 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-GR3P0CX67 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-LR1P0CX68 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W RAM1P22007 431 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W SLD2P34252 453 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W MRX12P47084 519 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-JR2P47099 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-DR1Q03856 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W YPR097WQ06839 1073 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-BRQ12217 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-NL2Q12470 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TY1A-GR2Q12485 440 aa7.45□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W SEC2P17065 759 aa7.44□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W FRA1Q07825 749 aa7.42□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W TEC1P18412 486 aa7.41□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W ATG3P40344 310 aa7.41□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W EMP47P43555 445 aa7.41□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W ALR1Q08269 859 aa7.41□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W GUT2P32191 649 aa7.4□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W SPT23P35210 1082 aa7.4□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W SAP30P38429 201 aa7.4□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W FIG4P42837 879 aa7.4□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W YPR084WQ06821 456 aa7.4□□□□□ -1.22
RPS31YLR167W GAL2P13181 574 aa7.39□□□□□ -1.23
RPS31YLR167W STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms