RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W SSA2P10592 639 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W VRP1P37370 817 aa8.69□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W YNL115CP53925 644 aa8.69□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W CSN12P47130 423 aa8.67□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W HPC2Q01448 625 aa8.66□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-DR4O74302 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-AP0CX57 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-ORP0CX59 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W XDJ1P39102 459 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-JR2P47099 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-DR1Q03856 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-BRQ12217 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-NL2Q12470 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W TY1A-GR2Q12485 440 aa8.65□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W KEX2P13134 814 aa8.64□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W MMP1Q12372 583 aa8.64□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W GUA1P38625 525 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W SEC2P17065 759 aa8.61□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W GYP1Q08484 637 aa8.61□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W PAT1P25644 796 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data8.59□□□□□ -1.03not detected
YLL047WYLL047W HGH1P48362 394 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W ERF2Q06551 359 aa8.59□□□□□ -1.03
YLL047WYLL047W SLY41P22215 453 aa8.58□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W AGE1Q04412 482 aa8.57□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W LAM6Q08001 693 aa8.57□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W ESS1P22696 170 aa8.54□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W SCJ1P25303 377 aa8.54□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W BRL1P38770 471 aa8.54□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W PUS6P53294 404 aa8.54□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W TUB4P53378 473 aa8.54□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YLL047WYLL047W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W TRM1P15565 570 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W RSC30P38781 883 aa8.51□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W RRN7P40992 514 aa8.51□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W TBF1Q02457 562 aa8.51□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W RAD59Q12223 238 aa8.5□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W YJU3P28321 313 aa8.49□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W RPA14P50106 137 aa8.49□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W TPD3P31383 635 aa8.48□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W PAC1P39946 494 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W TFB3Q03290 321 aa8.48□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.48□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W ERG12P07277 443 aa8.47□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W SDH2P21801 266 aa8.47□□□□□ -1.05
YLL047WYLL047W ARG8P18544 423 aa8.46□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W CSE4P36012 229 aa8.46□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W KXD1P53158 218 aa8.46□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W YPR097WQ06839 1073 aa8.45□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W ALR1Q08269 859 aa8.45□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W MOD5P07884 428 aa8.44□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W YDL206WQ12424 762 aa8.44□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W AMS1P22855 1083 aa8.43□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W PDC1P06169 563 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W DMA2P53924 522 aa8.42□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W RRD1P40454 393 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W HXT10P43581 546 aa8.41□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
YLL047WYLL047W YBL036CP38197 257 aa8.39□□□□□ -1.07
YLL047WYLL047W NAF1P53919 492 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YLL047WYLL047W DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YLL047WYLL047W PKC1P24583 1151 aa8.36□□□□□ -1.07
YLL047WYLL047W CST6P40535 587 aa8.35□□□□□ -1.07
YLL047WYLL047W BDP1P46678 594 aa8.35□□□□□ -1.07
YLL047WYLL047W VAC17P25591 423 aa8.29□□□□□ -1.08
YLL047WYLL047W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
YLL047WYLL047W HED1Q03937 162 aa8.29□□□□□ -1.08
YLL047WYLL047W RAS1P01119 309 aa8.28□□□□□ -1.08
YLL047WYLL047W BIO2P32451 375 aa8.28□□□□□ -1.08
YLL047WYLL047W TEC1P18412 486 aa8.27□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W FIG4P42837 879 aa8.27□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W YPP1P46951 817 aa8.27□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W YJL007CP47080 104 aa8.25□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W MRX12P47084 519 aa8.25□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W BIM1P40013 344 aa8.24□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W GUT2P32191 649 aa8.23□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W TAF7Q05021 590 aa8.23□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W YPR084WQ06821 456 aa8.23□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W FRA1Q07825 749 aa8.23□□□□□ -1.09
YLL047WYLL047W RTT106P40161 455 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.2 ms