RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	MRPL32	P25348	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	HPC2	Q01448	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	MRM1	P25270	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	SPC42	P36094	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	IES2	P40154	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	ATF2	P53296	535 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	VTH1	P40438	1549 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	VTH2	P40890	1549 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YKL050C	YKL050C	RRN6	P32786	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	ATG36	P46983	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	TSC11	P40061	1430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	SNT2	P53127	1403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	HEM3	P28789	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	MNN4	P36044	1178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	LAM6	Q08001	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	RTG3	P38165	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	RCR1	P38212	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	OSW7	P43611	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	TFB3	Q03290	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	OCA5	P38738	679 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	PDR10	P51533	1564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	YJR008W	P47085	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	MDG1	P53885	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL050C	YKL050C	DIT2	P21595	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	YAF9	P53930	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	MYO4	P32492	1471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	COQ8	P27697	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
YKL050C	YKL050C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	YOR1	P53049	1477 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	BCH2	P36122	765 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	EPS1	P40557	701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	USO1	P25386	1790 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	POL1	P13382	1468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	BIM1	P40013	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	TPO2	P53283	614 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	KEX1	P09620	729 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	NNF1	P47149	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	BUD3	P25558	1636 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	PKC1	P24583	1151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	YJL007C	P47080	104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	MLP2	P40457	1679 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YKL050C	YKL050C	CDC27	P38042	758 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	ATG32	P40458	529 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	UBX5	Q06682	500 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	PDR1	P12383	1068 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	CPS1	P27614	576 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
YKL050C	YKL050C	TOM20	P35180	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	CST6	P40535	587 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	BNR1	P40450	1375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	COX6	P00427	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	HAT1	Q12341	374 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	MAK10	Q02197	733 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	BDF1	P35817	686 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	SVF1	Q05515	481 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	STU1	P38198	1513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	TTI1	P36097	1038 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	CSN12	P47130	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	KIC1	P38692	1080 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	SEC20	P28791	383 aa		4.71	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	RNH70	P53331	553 aa		4.71	□□□□□ -1.65
YKL050C	YKL050C	YAP3	P38749	330 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	ERG12	P07277	443 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKL050C	YKL050C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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