RNA–Protein interactions for RNA: YGL163C

RAD54, Transcript of DNA-dependent ATPase that stimulates strand exchange, yeast

Gene RAD54, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD54	YGL163C	RKR1	Q04781	1562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAD54	YGL163C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAD54	YGL163C	GAL11	P19659	1081 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAD54	YGL163C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAD54	YGL163C	CSN12	P47130	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAD54	YGL163C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-C	P25384	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	AI2	P03876	854 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	DNF1	P32660	1571 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	ERP2	P39704	215 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	YBL036C	P38197	257 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	YOL057W	Q08225	711 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	PAN1	P32521	1480 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	CDC25	P04821	1589 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	YML083C	Q04526	418 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	YDL121C	Q07541	149 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	POL32	P47110	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	YOR1	P53049	1477 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	RAD2	P07276	1031 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	COX6	P00427	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	ISW1	P38144	1129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	ALG12	P53730	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	KAR1	P11927	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	BOI2	P39969	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	SPP41	P38904	1435 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RAD54	YGL163C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	PUP1	P25043	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	RCR1	P38212	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	BIO2	P32451	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	PRY3	P47033	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	BBC1	P47068	1157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	COQ8	P27697	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	GRX7	P38068	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	CIT2	P08679	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	IES1	P43579	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	YNL108C	P53929	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RAD54	YGL163C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	ATE1	P16639	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	THI12	P42883	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54	YGL163C	THI5	P43534	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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