RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	PKC1	P24583	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	OXP1	P28273	1286 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	GRX4	P32642	244 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	PBS2	P08018	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	DJP1	P40564	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
BCK2	YER167W	IPL1	P38991	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	MCM1	P11746	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	BIO2	P32451	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	FUI1	P38196	639 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	MUM2	P38236	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	PES4	P39684	611 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	BIM1	P40013	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	HAT1	Q12341	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	SPT7	P35177	1332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CDC11	P32458	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	PEA2	P40091	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	ALG12	P53730	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	VPS5	Q92331	675 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CIT2	P08679	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	ATG32	P40458	529 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	YGL081W	P53156	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	RAD51	P25454	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CPS1	P27614	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	RPN12	P32496	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	SEC9	P40357	651 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	RCF1	Q03713	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	SEC6	P32844	805 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CTF4	Q01454	927 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	DIT2	P21595	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	CST9	Q06032	482 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	REB1	P21538	810 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	SPT21	P35209	758 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	YJL007C	P47080	104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	HSP42	Q12329	375 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	SWI3	P32591	825 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	RTT106	P40161	455 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BCK2	YER167W	MET1	P36150	593 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	MEP1	P40260	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	IOC3	P43596	787 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	ERG12	P07277	443 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	PRI1	P10363	409 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	ATE1	P16639	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	PPH3	P32345	308 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	BFA1	P47113	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	YNL058C	P53947	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	GRX7	P38068	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	BDP1	P46678	594 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	SVF1	Q05515	481 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	CDC45	Q08032	650 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	IES2	P40154	320 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	CYB2	P00175	591 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	GPI8	P49018	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	YNL011C	P53980	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	PHM6	Q05637	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	BRF1	P29056	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	RAM2	P29703	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	STE5	P32917	917 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	TTI1	P36097	1038 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	HXT5	P38695	592 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	YML083C	Q04526	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BCK2	YER167W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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