RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W ERG12P07277 443 aa8.21□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W YJU3P28321 313 aa8.2□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W NCR1Q12200 1170 aa8.2□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W ARG8P18544 423 aa8.19□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W SEC61P32915 480 aa8.19□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W DPL1Q05567 589 aa8.19□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W YPR204WQ08995 1032 aa8.19□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W RTG2P32608 588 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W BMT6Q12291 365 aa8.18□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W YNL108CP53929 270 aa8.17□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W YML020WQ03722 664 aa8.16□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W CPS1P27614 576 aa8.15□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W TTI1P36097 1038 aa8.15□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W YRR1Q12172 810 aa8.15□□□□□ -1.1
VHS1YDR247W SLY41P22215 453 aa8.14□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W SLX8P40072 274 aa8.14□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W MID1P41821 548 aa8.14□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W PML39Q03760 334 aa8.14□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W MPC54Q08550 464 aa8.14□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W RTF1P53064 558 aa8.13□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W LAM6Q08001 693 aa8.13□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W YNL115CP53925 644 aa8.12□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W ISU2Q12056 156 aa8.12□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W RSC30P38781 883 aa8.1□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W PEX29Q03370 554 aa8.1□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
VHS1YDR247W ENO2P00925 437 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W SIS2P36024 562 aa8.08□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W NMA111P53920 997 aa8.07□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W ENO1P00924 437 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W TRM1P15565 570 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data8.06□□□□□ -1.12not detected
VHS1YDR247W NUD1P32336 851 aa8.05□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W PUS6P53294 404 aa8.05□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W KEX2P13134 814 aa8.04□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W RIM21P48565 533 aa8.03□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W MRX10Q05648 414 aa8.03□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W YDL129WQ07555 291 aa8.03□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W TY1B-DR4Q07793 1604 aa8.02□□□□□ -1.12
VHS1YDR247W NPL4P33755 580 aa8.02□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W YPP1P46951 817 aa8.02□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W NAF1P53919 492 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W TBF1Q02457 562 aa8.02□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W SAP30P38429 201 aa8.01□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W CDC3P32457 520 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W ERF2Q06551 359 aa8□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W PUP1P25043 261 aa7.99□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W YML083CQ04526 418 aa7.97□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W PDR1P12383 1068 aa7.97□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W TGL4P36165 910 aa7.97□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W MCM16Q12262 181 aa7.97□□□□□ -1.13
VHS1YDR247W SLD2P34252 453 aa7.96□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W ISM1P48526 1002 aa7.95□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W HAP5Q02516 242 aa7.95□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W HSL1P34244 1518 aa7.95□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W STR2P47164 639 aa7.94□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W YDL206WQ12424 762 aa7.94□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W PEP12P32854 288 aa7.93□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W ARH1P48360 493 aa7.91□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W TUB4P53378 473 aa7.91□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W RDS2P19541 446 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W RAM1P22007 431 aa7.9□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W RPA14P50106 137 aa7.9□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W AGE1Q04412 482 aa7.9□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W ENV9Q08651 330 aa7.9□□□□□ -1.14
VHS1YDR247W ISF1P32488 338 aa7.89□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W PRE3P38624 215 aa7.89□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W KTR7P40504 517 aa7.89□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W EMP47P43555 445 aa7.88□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W ECM23Q02710 187 aa7.88□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-DR4O74302 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-AP0CX57 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-ORP0CX59 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-DR5P0CX65 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-ER2P0CX66 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-GR3P0CX67 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-LR1P0CX68 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TEC1P18412 486 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-JR2P47099 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-DR1Q03856 440 aa7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
VHS1YDR247W ALR1Q08269 859 aa7.87□□□□□ -1.15
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