RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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UBXN8-209ENST00000620074 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.71■□□□□ 0.43
UBXN8-209ENST00000620074 RAPGEF3O95398 923 aa17.69■□□□□ 0.42
UBXN8-209ENST00000620074 ADGRL1O94910 1474 aa17.69■□□□□ 0.42
UBXN8-209ENST00000620074 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.68■□□□□ 0.42
UBXN8-209ENST00000620074 PREX2Q70Z35 1606 aa17.68■□□□□ 0.42
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UBXN8-209ENST00000620074 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.51■□□□□ 0.39
UBXN8-209ENST00000620074 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.5■□□□□ 0.39
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UBXN8-209ENST00000620074 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.49■□□□□ 0.39
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UBXN8-209ENST00000620074 ATP10AO60312 1499 aa17.49■□□□□ 0.39
UBXN8-209ENST00000620074 NCOA2Q15596 1464 aa17.49■□□□□ 0.39
UBXN8-209ENST00000620074 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.49■□□□□ 0.39
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UBXN8-209ENST00000620074 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
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UBXN8-209ENST00000620074 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.2■□□□□ 0.34
UBXN8-209ENST00000620074 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.18■□□□□ 0.34
UBXN8-209ENST00000620074 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.18■□□□□ 0.34
UBXN8-209ENST00000620074 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
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UBXN8-209ENST00000620074 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.16■□□□□ 0.34
UBXN8-209ENST00000620074 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
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