RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 HECW1Q76N89 1606 aa29.75■■■□□ 2.35
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TRAPPC3-209ENST00000616395 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP10AO60312 1499 aa29.64■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 STRCQ7RTU9 1775 aa29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLCH2O75038 1416 aa29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.58■■■□□ 2.33
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.42■■■□□ 2.3
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC3-209ENST00000616395 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.41■■■□□ 2.3
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TRAPPC3-209ENST00000616395 KDM5CP41229 1560 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 C3P01024 1663 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 EEA1Q15075 1411 aa29.35■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIF14Q15058 1648 aa29.33■■■□□ 2.29
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TRAPPC3-209ENST00000616395 AGLP35573 1532 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3-209ENST00000616395 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
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TRAPPC3-209ENST00000616395 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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TRAPPC3-209ENST00000616395 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABCC1P33527 1531 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3-209ENST00000616395 NPATQ14207 1427 aa29.12■■■□□ 2.25
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TRAPPC3-209ENST00000616395 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.09■■■□□ 2.25
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TRAPPC3-209ENST00000616395 PREX2Q70Z35 1606 aa29.07■■■□□ 2.24
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.96■■■□□ 2.23
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TRAPPC3-209ENST00000616395 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3-209ENST00000616395 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.63■■■□□ 2.17
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