RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SOCS7O14512 581 aa25.95■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ILDR2Q71H61 639 aa25.95■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP10AO60312 1499 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLCH2O75038 1416 aa25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.88■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EEA1Q15075 1411 aa25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STRCQ7RTU9 1775 aa25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.78■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTPRTO14522 1441 aa25.74■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AFAP1Q8N556 730 aa25.74■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.71■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FMN1Q68DA7 1419 aa25.69■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM5CP41229 1560 aa25.69■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF14Q15058 1648 aa25.68■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.65■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLIP1P30622 1438 aa25.64■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.64■■□□□ 1.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 REREQ9P2R6 1566 aa25.64■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C3P01024 1663 aa25.64■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.63■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.62■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.6■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCA6Q8N139 1617 aa25.59■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.58■■□□□ 1.69
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NCOA1Q15788 1441 aa25.57■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AGLP35573 1532 aa25.57■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.56■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.52■■□□□ 1.68
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.5■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.49■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC1P33527 1531 aa25.48■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPATQ14207 1427 aa25.47■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PREX2Q70Z35 1606 aa25.45■■□□□ 1.67
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.45■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.45■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZMYM3Q14202 1370 aa25.43■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.42■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MROH2AA6NES4 1674 aa25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PKD2Q13563 968 aa25.4■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.38■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.37■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLA2R1Q13018 1463 aa25.35■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.35■■□□□ 1.65
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GGT6Q6P531 493 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTPRKQ15262 1439 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIP4K2BP78356 416 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP7AQ04656 1500 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A2MP01023 1474 aa25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSPA1LP34931 641 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TOM1O60784 492 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLXNC1O60486 1568 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CPS1P31327 1500 aa25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.14■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNRQ92752 1358 aa25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.06■■□□□ 1.6
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