RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 SYNJ2O15056 1496 aa28.21■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 ERCC6Q03468 1493 aa28.21■■■□□ 2.11
TIMM44-210ENST00000599939 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.2■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 KIF14Q15058 1648 aa28.16■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.14■■■□□ 2.1
TIMM44-210ENST00000599939 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 FKBP8Q14318 412 aa28.12■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 NUP160Q12769 1436 aa28.11■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.11■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 PZPP20742 1482 aa28.09■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 NCOA1Q15788 1441 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM44-210ENST00000599939 BCANQ96GW7 911 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 ADGRL2O95490 1459 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 FBLN2P98095 1184 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 JPH4Q96JJ6 628 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC7Q96M83 1385 aa28.02■■■□□ 2.08
TIMM44-210ENST00000599939 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TIMM44-210ENST00000599939 NEFLP07196 543 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM44-210ENST00000599939 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM44-210ENST00000599939 ABCA8O94911 1581 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM44-210ENST00000599939 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.99■■■□□ 2.07
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
TIMM44-210ENST00000599939 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
TIMM44-210ENST00000599939 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.94■■■□□ 2.06
TIMM44-210ENST00000599939 MBD5Q9P267 1494 aa27.94■■■□□ 2.06
TIMM44-210ENST00000599939 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM44-210ENST00000599939 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM44-210ENST00000599939 ATP10BO94823 1461 aa27.91■■■□□ 2.06
TIMM44-210ENST00000599939 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.89■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.88■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.88■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.87■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC184Q52MB2 194 aa27.87■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 MYT1Q01538 1121 aa27.86■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 PKD2Q13563 968 aa27.84■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.84■■■□□ 2.05
TIMM44-210ENST00000599939 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.77■■■□□ 2.04
TIMM44-210ENST00000599939 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.77■■■□□ 2.04
TIMM44-210ENST00000599939 NUP155O75694 1391 aa27.75■■■□□ 2.03
TIMM44-210ENST00000599939 USP47Q96K76 1375 aa27.75■■■□□ 2.03
TIMM44-210ENST00000599939 KDM5CP41229 1560 aa27.74■■■□□ 2.03
TIMM44-210ENST00000599939 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.74■■■□□ 2.03
TIMM44-210ENST00000599939 MRS2Q9HD23 443 aa27.73■■■□□ 2.03
TIMM44-210ENST00000599939 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.71■■■□□ 2.03
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.7■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 PTPRGP23470 1445 aa27.69■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 KIF15Q9NS87 1388 aa27.69■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.69■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.69■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 TSPY4P0CV99 314 aa27.68■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 TSPY10P0CW01 314 aa27.68■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.68■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.68■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 PREX2Q70Z35 1606 aa27.68■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
TIMM44-210ENST00000599939 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.63■■■□□ 2.01
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.63■■■□□ 2.01
TIMM44-210ENST00000599939 CHD1O14646 1710 aa27.62■■■□□ 2.01
TIMM44-210ENST00000599939 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
TIMM44-210ENST00000599939 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
TIMM44-210ENST00000599939 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.57■■■□□ 2
TIMM44-210ENST00000599939 SHROOM2Q13796 1616 aa27.55■■■□□ 2
TIMM44-210ENST00000599939 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.55■■■□□ 2
TIMM44-210ENST00000599939 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.54■■■□□ 2
TIMM44-210ENST00000599939 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TIMM44-210ENST00000599939 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.53■■■□□ 2
TIMM44-210ENST00000599939 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.53■■■□□ 2
TIMM44-210ENST00000599939 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.51■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.5■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.5■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.48■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.48■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.48■■□□□ 1.99
TIMM44-210ENST00000599939 UNC13BO14795 1591 aa27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms