RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599454.5

PNKP-212, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-212ENST00000599454 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.96■■■■□ 3.19
PNKP-212ENST00000599454 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.96■■■■□ 3.19
PNKP-212ENST00000599454 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
PNKP-212ENST00000599454 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.95■■■■□ 3.19
PNKP-212ENST00000599454 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.95■■■■□ 3.19
PNKP-212ENST00000599454 KIF14Q15058 1648 aa34.95■■■■□ 3.18
PNKP-212ENST00000599454 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.92■■■■□ 3.18
PNKP-212ENST00000599454 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.9■■■■□ 3.18
PNKP-212ENST00000599454 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
PNKP-212ENST00000599454 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.89■■■■□ 3.18
PNKP-212ENST00000599454 CLIP1P30622 1438 aa34.87■■■■□ 3.17
PNKP-212ENST00000599454 ATP10AO60312 1499 aa34.84■■■■□ 3.17
PNKP-212ENST00000599454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.81■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.81■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.81■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 FBXO41Q8TF61 875 aa34.8■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.77■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 KDM5CP41229 1560 aa34.77■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.76■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 MLECQ14165 292 aa34.76■■■■□ 3.16
PNKP-212ENST00000599454 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.74■■■■□ 3.15
PNKP-212ENST00000599454 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.72■■■■□ 3.15
PNKP-212ENST00000599454 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.71■■■■□ 3.15
PNKP-212ENST00000599454 PREX2Q70Z35 1606 aa34.7■■■■□ 3.14
PNKP-212ENST00000599454 REREQ9P2R6 1566 aa34.66■■■■□ 3.14
PNKP-212ENST00000599454 HSPA2P54652 639 aa34.65■■■■□ 3.14
PNKP-212ENST00000599454 AFAP1Q8N556 730 aa34.65■■■■□ 3.14
PNKP-212ENST00000599454 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.65■■■■□ 3.14
PNKP-212ENST00000599454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.64■■■■□ 3.14
PNKP-212ENST00000599454 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.62■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 ABCC1P33527 1531 aa34.61■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.61■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.59■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.58■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.58■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 ABCA6Q8N139 1617 aa34.58■■■■□ 3.13
PNKP-212ENST00000599454 AGLP35573 1532 aa34.52■■■■□ 3.12
PNKP-212ENST00000599454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.51■■■■□ 3.12
PNKP-212ENST00000599454 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.49■■■■□ 3.11
PNKP-212ENST00000599454 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PNKP-212ENST00000599454 C3P01024 1663 aa34.44■■■■□ 3.1
PNKP-212ENST00000599454 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.42■■■■□ 3.1
PNKP-212ENST00000599454 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.4■■■■□ 3.1
PNKP-212ENST00000599454 STRCQ7RTU9 1775 aa34.39■■■■□ 3.1
PNKP-212ENST00000599454 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
PNKP-212ENST00000599454 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
PNKP-212ENST00000599454 CERKQ8TCT0 537 aa34.36■■■■□ 3.09
PNKP-212ENST00000599454 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.35■■■■□ 3.09
PNKP-212ENST00000599454 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.35■■■■□ 3.09
PNKP-212ENST00000599454 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.34■■■■□ 3.09
PNKP-212ENST00000599454 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PNKP-212ENST00000599454 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.31■■■■□ 3.08
PNKP-212ENST00000599454 MROH2AA6NES4 1674 aa34.29■■■■□ 3.08
PNKP-212ENST00000599454 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.29■■■■□ 3.08
PNKP-212ENST00000599454 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PNKP-212ENST00000599454 ATP7AQ04656 1500 aa34.25■■■■□ 3.07
PNKP-212ENST00000599454 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.24■■■■□ 3.07
PNKP-212ENST00000599454 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
PNKP-212ENST00000599454 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
PNKP-212ENST00000599454 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
PNKP-212ENST00000599454 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.22■■■■□ 3.07
PNKP-212ENST00000599454 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.22■■■■□ 3.07
PNKP-212ENST00000599454 PTPRTO14522 1441 aa34.2■■■■□ 3.06
PNKP-212ENST00000599454 PLXNC1O60486 1568 aa34.19■■■■□ 3.06
PNKP-212ENST00000599454 NPATQ14207 1427 aa34.18■■■■□ 3.06
PNKP-212ENST00000599454 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.14■■■■□ 3.06
PNKP-212ENST00000599454 A2MP01023 1474 aa34.14■■■■□ 3.06
PNKP-212ENST00000599454 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.14■■■■□ 3.06
PNKP-212ENST00000599454 TIAM1Q13009 1591 aa34.12■■■■□ 3.05
PNKP-212ENST00000599454 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
PNKP-212ENST00000599454 ZMYM3Q14202 1370 aa34.11■■■■□ 3.05
PNKP-212ENST00000599454 NCOA1Q15788 1441 aa34.09■■■■□ 3.05
PNKP-212ENST00000599454 CEP162Q5TB80 1403 aa34.04■■■■□ 3.04
PNKP-212ENST00000599454 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.03■■■■□ 3.04
PNKP-212ENST00000599454 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
PNKP-212ENST00000599454 MBD5Q9P267 1494 aa34.01■■■■□ 3.04
PNKP-212ENST00000599454 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.01■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.99■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.97■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 PTPRKQ15262 1439 aa33.96■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 GGT6Q6P531 493 aa33.96■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.95■■■■□ 3.03
PNKP-212ENST00000599454 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PNKP-212ENST00000599454 PLA2R1Q13018 1463 aa33.92■■■■□ 3.02
PNKP-212ENST00000599454 NCOA2Q15596 1464 aa33.88■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.88■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.86■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.85■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.85■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 PKD2Q13563 968 aa33.85■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.82■■■■□ 3.01
PNKP-212ENST00000599454 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.79■■■■□ 3
PNKP-212ENST00000599454 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.79■■■■□ 3
PNKP-212ENST00000599454 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.77■■■■□ 3
PNKP-212ENST00000599454 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
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