RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594624.6

LIPE-AS1-204, LIPE antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPE-AS1, Length 1,448 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.34■■□□□ 1.17
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.34■■□□□ 1.17
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CLIP1P30622 1438 aa22.29■■□□□ 1.16
LIPE-AS1-204ENST00000594624 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.29■■□□□ 1.16
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 KIF14Q15058 1648 aa22.25■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.24■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.24■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MLECQ14165 292 aa22.23■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ATP10AO60312 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 FBXO41Q8TF61 875 aa22.22■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.21■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.2■■□□□ 1.15
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.2■■□□□ 1.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.2■■□□□ 1.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.18■■□□□ 1.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.17■■□□□ 1.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.16■■□□□ 1.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 AFAP1Q8N556 730 aa22.15■■□□□ 1.14
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.13■■□□□ 1.13
LIPE-AS1-204ENST00000594624 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.13■■□□□ 1.13
LIPE-AS1-204ENST00000594624 HSPA2P54652 639 aa22.13■■□□□ 1.13
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.12■■□□□ 1.13
LIPE-AS1-204ENST00000594624 KDM5CP41229 1560 aa22.11■■□□□ 1.13
LIPE-AS1-204ENST00000594624 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.07■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PREX2Q70Z35 1606 aa22.04■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.04■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 REREQ9P2R6 1566 aa22.03■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.02■■□□□ 1.12
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ABCC1P33527 1531 aa22.02■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.01■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 FOXD1Q16676 465 aa22■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.99■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.98■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 AGLP35573 1532 aa21.98■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.98■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ABCA6Q8N139 1617 aa21.96■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.96■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CERKQ8TCT0 537 aa21.95■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.94■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.93■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.91■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.9■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.9■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.89■■□□□ 1.1
LIPE-AS1-204ENST00000594624 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.89■■□□□ 1.09
LIPE-AS1-204ENST00000594624 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.88■■□□□ 1.09
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.87■■□□□ 1.09
LIPE-AS1-204ENST00000594624 C3P01024 1663 aa21.85■■□□□ 1.09
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NPATQ14207 1427 aa21.81■■□□□ 1.08
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ATP7AQ04656 1500 aa21.81■■□□□ 1.08
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PTPRTO14522 1441 aa21.8■■□□□ 1.08
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZMYM3Q14202 1370 aa21.8■■□□□ 1.08
LIPE-AS1-204ENST00000594624 STRCQ7RTU9 1775 aa21.79■■□□□ 1.08
LIPE-AS1-204ENST00000594624 A2MP01023 1474 aa21.78■■□□□ 1.08
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.78■■□□□ 1.08
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MROH2AA6NES4 1674 aa21.76■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.75■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 GGT6Q6P531 493 aa21.74■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CEP162Q5TB80 1403 aa21.74■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PLXNC1O60486 1568 aa21.73■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NCOA1Q15788 1441 aa21.72■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TIAM1Q13009 1591 aa21.71■■□□□ 1.07
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.7■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.69■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MBD5Q9P267 1494 aa21.68■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.68■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.66■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PTPRKQ15262 1439 aa21.65■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PKD2Q13563 968 aa21.64■■□□□ 1.06
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NCOA2Q15596 1464 aa21.62■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.62■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.62■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.61■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 PLA2R1Q13018 1463 aa21.61■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 KIF3BO15066 747 aa21.6■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.59■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TSPY4P0CV99 314 aa21.59■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 TSPY10P0CW01 314 aa21.59■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.58■■□□□ 1.05
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.58■■□□□ 1.04
LIPE-AS1-204ENST00000594624 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
LIPE-AS1-204ENST00000594624 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms