RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.84■■■■□ 3.65
MBD3-211ENST00000592965 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.83■■■■□ 3.65
MBD3-211ENST00000592965 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.82■■■■□ 3.64
MBD3-211ENST00000592965 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.82■■■■□ 3.64
MBD3-211ENST00000592965 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.79■■■■□ 3.64
MBD3-211ENST00000592965 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.78■■■■□ 3.64
MBD3-211ENST00000592965 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.75■■■■□ 3.63
MBD3-211ENST00000592965 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.75■■■■□ 3.63
MBD3-211ENST00000592965 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
MBD3-211ENST00000592965 PREX2Q70Z35 1606 aa37.72■■■■□ 3.63
MBD3-211ENST00000592965 MADDQ8WXG6 1647 aa37.72■■■■□ 3.63
MBD3-211ENST00000592965 PTPRMP28827 1452 aa37.72■■■■□ 3.63
MBD3-211ENST00000592965 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.69■■■■□ 3.62
MBD3-211ENST00000592965 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.67■■■■□ 3.62
MBD3-211ENST00000592965 KDM5CP41229 1560 aa37.65■■■■□ 3.62
MBD3-211ENST00000592965 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.64■■■■□ 3.62
MBD3-211ENST00000592965 ABCC1P33527 1531 aa37.59■■■■□ 3.61
MBD3-211ENST00000592965 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
MBD3-211ENST00000592965 ATP10AO60312 1499 aa37.58■■■■□ 3.61
MBD3-211ENST00000592965 CEP162Q5TB80 1403 aa37.56■■■■□ 3.6
MBD3-211ENST00000592965 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.56■■■■□ 3.6
MBD3-211ENST00000592965 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.54■■■■□ 3.6
MBD3-211ENST00000592965 AFAP1Q8N556 730 aa37.51■■■■□ 3.6
MBD3-211ENST00000592965 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.5■■■■□ 3.59
MBD3-211ENST00000592965 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.48■■■■□ 3.59
MBD3-211ENST00000592965 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.47■■■■□ 3.59
MBD3-211ENST00000592965 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.46■■■■□ 3.59
MBD3-211ENST00000592965 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
MBD3-211ENST00000592965 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.45■■■■□ 3.59
MBD3-211ENST00000592965 REREQ9P2R6 1566 aa37.45■■■■□ 3.59
MBD3-211ENST00000592965 ABCA6Q8N139 1617 aa37.43■■■■□ 3.58
MBD3-211ENST00000592965 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.42■■■■□ 3.58
MBD3-211ENST00000592965 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.42■■■■□ 3.58
MBD3-211ENST00000592965 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.38■■■■□ 3.57
MBD3-211ENST00000592965 MLECQ14165 292 aa37.38■■■■□ 3.57
MBD3-211ENST00000592965 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.35■■■■□ 3.57
MBD3-211ENST00000592965 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.35■■■■□ 3.57
MBD3-211ENST00000592965 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.34■■■■□ 3.57
MBD3-211ENST00000592965 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.34■■■■□ 3.57
MBD3-211ENST00000592965 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.34■■■■□ 3.57
MBD3-211ENST00000592965 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.31■■■■□ 3.56
MBD3-211ENST00000592965 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
MBD3-211ENST00000592965 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.29■■■■□ 3.56
MBD3-211ENST00000592965 AGLP35573 1532 aa37.29■■■■□ 3.56
MBD3-211ENST00000592965 TIAM1Q13009 1591 aa37.29■■■■□ 3.56
MBD3-211ENST00000592965 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
MBD3-211ENST00000592965 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.2■■■■□ 3.55
MBD3-211ENST00000592965 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.19■■■■□ 3.543e-6■■■■□ 22.1
MBD3-211ENST00000592965 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.19■■■■□ 3.54
MBD3-211ENST00000592965 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
MBD3-211ENST00000592965 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.18■■■■□ 3.54
MBD3-211ENST00000592965 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
MBD3-211ENST00000592965 ATP7AQ04656 1500 aa37.17■■■■□ 3.54
MBD3-211ENST00000592965 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
MBD3-211ENST00000592965 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.12■■■■□ 3.53
MBD3-211ENST00000592965 NCOA2Q15596 1464 aa37.11■■■■□ 3.53
MBD3-211ENST00000592965 PLXNC1O60486 1568 aa37.08■■■■□ 3.53
MBD3-211ENST00000592965 MBD5Q9P267 1494 aa37.07■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 C3P01024 1663 aa37.06■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 HSPA2P54652 639 aa37.03■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.02■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.01■■■■□ 3.52
MBD3-211ENST00000592965 A2MP01023 1474 aa37.01■■■■□ 3.51
MBD3-211ENST00000592965 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.01■■■■□ 3.51
MBD3-211ENST00000592965 MAP3K1Q13233 1512 aa37■■■■□ 3.51
MBD3-211ENST00000592965 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
MBD3-211ENST00000592965 MROH2AA6NES4 1674 aa36.96■■■■□ 3.51
MBD3-211ENST00000592965 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.96■■■■□ 3.51
MBD3-211ENST00000592965 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.94■■■■□ 3.5
MBD3-211ENST00000592965 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.93■■■■□ 3.5
MBD3-211ENST00000592965 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.93■■■■□ 3.5
MBD3-211ENST00000592965 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.87■■■■□ 3.49
MBD3-211ENST00000592965 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.84■■■■□ 3.49
MBD3-211ENST00000592965 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
MBD3-211ENST00000592965 NPATQ14207 1427 aa36.82■■■■□ 3.48
MBD3-211ENST00000592965 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
MBD3-211ENST00000592965 ZMYM3Q14202 1370 aa36.78■■■■□ 3.48
MBD3-211ENST00000592965 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
MBD3-211ENST00000592965 STRCQ7RTU9 1775 aa36.78■■■■□ 3.48
MBD3-211ENST00000592965 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.76■■■■□ 3.48
MBD3-211ENST00000592965 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.74■■■■□ 3.47
MBD3-211ENST00000592965 GGT6Q6P531 493 aa36.73■■■■□ 3.47
MBD3-211ENST00000592965 MIA2Q96PC5 1412 aa36.73■■■■□ 3.47
MBD3-211ENST00000592965 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.7■■■■□ 3.46
MBD3-211ENST00000592965 FBXO41Q8TF61 875 aa36.69■■■■□ 3.46
MBD3-211ENST00000592965 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.67■■■■□ 3.46
MBD3-211ENST00000592965 PTPRKQ15262 1439 aa36.66■■■■□ 3.46
MBD3-211ENST00000592965 TSPY4P0CV99 314 aa36.65■■■■□ 3.46
MBD3-211ENST00000592965 TSPY10P0CW01 314 aa36.65■■■■□ 3.46
MBD3-211ENST00000592965 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.63■■■■□ 3.45
MBD3-211ENST00000592965 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.63■■■■□ 3.45
MBD3-211ENST00000592965 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
MBD3-211ENST00000592965 APLP2Q06481 763 aa36.61■■■■□ 3.45
MBD3-211ENST00000592965 KIF3BO15066 747 aa36.6■■■■□ 3.45
MBD3-211ENST00000592965 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.59■■■■□ 3.45
MBD3-211ENST00000592965 NCOA1Q15788 1441 aa36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms