RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT1-208	ENST00000587465	PTPRM	P28827	1452 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TNNT1-208	ENST00000587465	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TNNT1-208	ENST00000587465	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
TNNT1-208	ENST00000587465	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TNNT1-208	ENST00000587465	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TNNT1-208	ENST00000587465	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
TNNT1-208	ENST00000587465	CLIP1	P30622	1438 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TNNT1-208	ENST00000587465	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TNNT1-208	ENST00000587465	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TNNT1-208	ENST00000587465	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TNNT1-208	ENST00000587465	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TNNT1-208	ENST00000587465	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TNNT1-208	ENST00000587465	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.66	■■■□□ 2.66
TNNT1-208	ENST00000587465	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.64	■■■□□ 2.66
TNNT1-208	ENST00000587465	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.63	■■■□□ 2.65
TNNT1-208	ENST00000587465	KDM5C	P41229	1560 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TNNT1-208	ENST00000587465	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TNNT1-208	ENST00000587465	MLEC	Q14165	292 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TNNT1-208	ENST00000587465	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TNNT1-208	ENST00000587465	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.56	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	ABCC1	P33527	1531 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.55	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	ATP10A	O60312	1499 aa		31.54	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.54	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.52	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.52	■■■□□ 2.64
TNNT1-208	ENST00000587465	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.51	■■■□□ 2.63
TNNT1-208	ENST00000587465	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.49	■■■□□ 2.63
TNNT1-208	ENST00000587465	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.47	■■■□□ 2.63
TNNT1-208	ENST00000587465	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TNNT1-208	ENST00000587465	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
TNNT1-208	ENST00000587465	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
TNNT1-208	ENST00000587465	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TNNT1-208	ENST00000587465	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TNNT1-208	ENST00000587465	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TNNT1-208	ENST00000587465	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
TNNT1-208	ENST00000587465	HSPA2	P54652	639 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TNNT1-208	ENST00000587465	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TNNT1-208	ENST00000587465	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TNNT1-208	ENST00000587465	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TNNT1-208	ENST00000587465	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TNNT1-208	ENST00000587465	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.31	■■■□□ 2.6
TNNT1-208	ENST00000587465	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.3	■■■□□ 2.6
TNNT1-208	ENST00000587465	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TNNT1-208	ENST00000587465	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TNNT1-208	ENST00000587465	AGL	P35573	1532 aa		31.24	■■■□□ 2.59
TNNT1-208	ENST00000587465	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TNNT1-208	ENST00000587465	C3	P01024	1663 aa		31.22	■■■□□ 2.59
TNNT1-208	ENST00000587465	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
TNNT1-208	ENST00000587465	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TNNT1-208	ENST00000587465	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TNNT1-208	ENST00000587465	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.58
TNNT1-208	ENST00000587465	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
TNNT1-208	ENST00000587465	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TNNT1-208	ENST00000587465	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.14	■■■□□ 2.57
TNNT1-208	ENST00000587465	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TNNT1-208	ENST00000587465	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TNNT1-208	ENST00000587465	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TNNT1-208	ENST00000587465	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TNNT1-208	ENST00000587465	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
TNNT1-208	ENST00000587465	A2M	P01023	1474 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TNNT1-208	ENST00000587465	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TNNT1-208	ENST00000587465	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
TNNT1-208	ENST00000587465	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.02	■■■□□ 2.56
TNNT1-208	ENST00000587465	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.02	■■■□□ 2.56
TNNT1-208	ENST00000587465	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.01	■■■□□ 2.55
TNNT1-208	ENST00000587465	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MROH2A	A6NES4	1674 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	30.98	■■■□□ 2.55
TNNT1-208	ENST00000587465	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	30.96	■■■□□ 2.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		30.93	■■■□□ 2.54
TNNT1-208	ENST00000587465	GGT6	Q6P531	493 aa		30.92	■■■□□ 2.54
TNNT1-208	ENST00000587465	FBXO41	Q8TF61	875 aa		30.92	■■■□□ 2.54
TNNT1-208	ENST00000587465	ZMYM3	Q14202	1370 aa		30.92	■■■□□ 2.54
TNNT1-208	ENST00000587465	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		30.89	■■■□□ 2.53
TNNT1-208	ENST00000587465	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		30.85	■■■□□ 2.53
TNNT1-208	ENST00000587465	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	30.83	■■■□□ 2.53
TNNT1-208	ENST00000587465	MAP3K1	Q13233	1512 aa		30.83	■■■□□ 2.53
TNNT1-208	ENST00000587465	NPAT	Q14207	1427 aa		30.82	■■■□□ 2.52
TNNT1-208	ENST00000587465	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		30.82	■■■□□ 2.52
TNNT1-208	ENST00000587465	PTPRK	Q15262	1439 aa		30.81	■■■□□ 2.52
TNNT1-208	ENST00000587465	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		30.77	■■■□□ 2.52
TNNT1-208	ENST00000587465	NCOA1	Q15788	1441 aa		30.77	■■■□□ 2.52
TNNT1-208	ENST00000587465	CERK	Q8TCT0	537 aa		30.77	■■■□□ 2.52
TNNT1-208	ENST00000587465	KIF3B	O15066	747 aa		30.76	■■■□□ 2.51
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	30.76	■■■□□ 2.51
TNNT1-208	ENST00000587465	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		30.74	■■■□□ 2.51
TNNT1-208	ENST00000587465	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	30.73	■■■□□ 2.51
TNNT1-208	ENST00000587465	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		30.71	■■■□□ 2.51
TNNT1-208	ENST00000587465	PTPRT	O14522	1441 aa		30.7	■■■□□ 2.5
TNNT1-208	ENST00000587465	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		30.69	■■■□□ 2.5
TNNT1-208	ENST00000587465	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		30.68	■■■□□ 2.5
TNNT1-208	ENST00000587465	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	30.67	■■■□□ 2.5
TNNT1-208	ENST00000587465	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		30.66	■■■□□ 2.5
TNNT1-208	ENST00000587465	MIA2	Q96PC5	1412 aa		30.65	■■■□□ 2.5

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