RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587256.1

ATG4D-207, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-207ENST00000587256 RICTORQ6R327 1708 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4D-207ENST00000587256 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.58■■□□□ 1.36
ATG4D-207ENST00000587256 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4D-207ENST00000587256 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4D-207ENST00000587256 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4D-207ENST00000587256 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4D-207ENST00000587256 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4D-207ENST00000587256 TIAM1Q13009 1591 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4D-207ENST00000587256 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4D-207ENST00000587256 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-207ENST00000587256 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-207ENST00000587256 ABCC1P33527 1531 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-207ENST00000587256 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-207ENST00000587256 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-207ENST00000587256 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-207ENST00000587256 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 KDM5CP41229 1560 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 MAP3K1Q13233 1512 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 NCOA2Q15596 1464 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG4D-207ENST00000587256 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 AFAP1Q8N556 730 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 APLP2Q06481 763 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4D-207ENST00000587256 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 ATP10AO60312 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 ABCA6Q8N139 1617 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4D-207ENST00000587256 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 MADDQ8WXG6 1647 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 ATP7AQ04656 1500 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 REREQ9P2R6 1566 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ATG4D-207ENST00000587256 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4D-207ENST00000587256 MBD5Q9P267 1494 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG4D-207ENST00000587256 MLECQ14165 292 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG4D-207ENST00000587256 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4D-207ENST00000587256 PTPRMP28827 1452 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4D-207ENST00000587256 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.14■■□□□ 1.3
ATG4D-207ENST00000587256 MIA2Q96PC5 1412 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4D-207ENST00000587256 AGLP35573 1532 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4D-207ENST00000587256 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4D-207ENST00000587256 A2MP01023 1474 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4D-207ENST00000587256 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4D-207ENST00000587256 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.08■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 PLXNC1O60486 1568 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 TSPY4P0CV99 314 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 TSPY10P0CW01 314 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-207ENST00000587256 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ATG4D-207ENST00000587256 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-207ENST00000587256 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-207ENST00000587256 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-207ENST00000587256 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 DAPK1P53355 1430 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 ABCC5O15440 1437 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 GGT6Q6P531 493 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 C3P01024 1663 aa22.9■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ATG4D-207ENST00000587256 MROH2AA6NES4 1674 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 KIF3BO15066 747 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 KIF15Q9NS87 1388 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4D-207ENST00000587256 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4D-207ENST00000587256 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4D-207ENST00000587256 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.81■■□□□ 1.24
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