RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-215ENST00000582821 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.23■■□□□ 1.15
GGA3-215ENST00000582821 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.22■■□□□ 1.15
GGA3-215ENST00000582821 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.21■■□□□ 1.15
GGA3-215ENST00000582821 PREX2Q70Z35 1606 aa22.2■■□□□ 1.14
GGA3-215ENST00000582821 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.19■■□□□ 1.14
GGA3-215ENST00000582821 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.17■■□□□ 1.14
GGA3-215ENST00000582821 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.17■■□□□ 1.14
GGA3-215ENST00000582821 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GGA3-215ENST00000582821 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.16■■□□□ 1.14
GGA3-215ENST00000582821 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.16■■□□□ 1.14
GGA3-215ENST00000582821 MAP3K1Q13233 1512 aa22.12■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 TIAM1Q13009 1591 aa22.12■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.11■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.11■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 AFAP1Q8N556 730 aa22.09■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 ABCC1P33527 1531 aa22.08■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.08■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.08■■□□□ 1.13
GGA3-215ENST00000582821 KDM5CP41229 1560 aa22.08■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.07■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.05■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.05■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.05■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.04■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 NCOA2Q15596 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.03■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.03■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 ATP10AO60312 1499 aa22.03■■□□□ 1.12
GGA3-215ENST00000582821 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 ADAMTSL3P82987 1691 aa22■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.99■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.99■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 APLP2Q06481 763 aa21.98■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.97■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.97■■□□□ 1.11
GGA3-215ENST00000582821 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.94■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.94■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.94■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 REREQ9P2R6 1566 aa21.93■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.92■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 MBD5Q9P267 1494 aa21.92■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.91■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 ABCA6Q8N139 1617 aa21.9■■□□□ 1.1
GGA3-215ENST00000582821 PTPRMP28827 1452 aa21.87■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 MADDQ8WXG6 1647 aa21.87■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 AGLP35573 1532 aa21.86■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 MIA2Q96PC5 1412 aa21.86■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.85■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.85■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.85■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 ATP7AQ04656 1500 aa21.85■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 MLECQ14165 292 aa21.84■■□□□ 1.09
GGA3-215ENST00000582821 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.81■■□□□ 1.08
GGA3-215ENST00000582821 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.81■■□□□ 1.08
GGA3-215ENST00000582821 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GGA3-215ENST00000582821 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.78■■□□□ 1.08
GGA3-215ENST00000582821 TSPY4P0CV99 314 aa21.77■■□□□ 1.08
GGA3-215ENST00000582821 TSPY10P0CW01 314 aa21.77■■□□□ 1.08
GGA3-215ENST00000582821 A2MP01023 1474 aa21.77■■□□□ 1.07
GGA3-215ENST00000582821 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.75■■□□□ 1.07
GGA3-215ENST00000582821 PLXNC1O60486 1568 aa21.74■■□□□ 1.07
GGA3-215ENST00000582821 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
GGA3-215ENST00000582821 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.71■■□□□ 1.07
GGA3-215ENST00000582821 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.7■■□□□ 1.06
GGA3-215ENST00000582821 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.7■■□□□ 1.06
GGA3-215ENST00000582821 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.69■■□□□ 1.06
GGA3-215ENST00000582821 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
GGA3-215ENST00000582821 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
GGA3-215ENST00000582821 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.67■■□□□ 1.06
GGA3-215ENST00000582821 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
GGA3-215ENST00000582821 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 ABCC5O15440 1437 aa21.63■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 GGT6Q6P531 493 aa21.63■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.62■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.61■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 KIF3BO15066 747 aa21.6■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 MROH2AA6NES4 1674 aa21.6■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 C3P01024 1663 aa21.6■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.59■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 DAPK1P53355 1430 aa21.59■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 ZMYM3Q14202 1370 aa21.59■■□□□ 1.05
GGA3-215ENST00000582821 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.57■■□□□ 1.04
GGA3-215ENST00000582821 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GGA3-215ENST00000582821 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.54■■□□□ 1.04
GGA3-215ENST00000582821 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.54■■□□□ 1.04
GGA3-215ENST00000582821 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GGA3-215ENST00000582821 NPATQ14207 1427 aa21.53■■□□□ 1.04
GGA3-215ENST00000582821 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.53■■□□□ 1.04
GGA3-215ENST00000582821 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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