RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576761.5

PITPNA-211, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, human

TSL 4

Gene PITPNA, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNA-211	ENST00000576761	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.7	■■■■■ 4.27
PITPNA-211	ENST00000576761	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.68	■■■■■ 4.26
PITPNA-211	ENST00000576761	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.68	■■■■■ 4.26
PITPNA-211	ENST00000576761	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.67	■■■■■ 4.26
PITPNA-211	ENST00000576761	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PITPNA-211	ENST00000576761	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PITPNA-211	ENST00000576761	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.65	■■■■■ 4.26
PITPNA-211	ENST00000576761	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.61	■■■■■ 4.25
PITPNA-211	ENST00000576761	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.61	■■■■■ 4.25
PITPNA-211	ENST00000576761	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PITPNA-211	ENST00000576761	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.55	■■■■■ 4.24
PITPNA-211	ENST00000576761	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.53	■■■■■ 4.24
PITPNA-211	ENST00000576761	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.51	■■■■■ 4.24
PITPNA-211	ENST00000576761	PTPRM	P28827	1452 aa		41.51	■■■■■ 4.24
PITPNA-211	ENST00000576761	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.5	■■■■■ 4.23
PITPNA-211	ENST00000576761	KDM5C	P41229	1560 aa		41.48	■■■■■ 4.23
PITPNA-211	ENST00000576761	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.47	■■■■■ 4.23
PITPNA-211	ENST00000576761	ATP10A	O60312	1499 aa		41.44	■■■■■ 4.22
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCC1	P33527	1531 aa		41.44	■■■■■ 4.22
PITPNA-211	ENST00000576761	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.43	■■■■■ 4.22
PITPNA-211	ENST00000576761	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.4	■■■■■ 4.22
PITPNA-211	ENST00000576761	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.39	■■■■■ 4.22
PITPNA-211	ENST00000576761	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.39	■■■■■ 4.22
PITPNA-211	ENST00000576761	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.38	■■■■■ 4.22
PITPNA-211	ENST00000576761	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.36	■■■■■ 4.21
PITPNA-211	ENST00000576761	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		41.35	■■■■■ 4.21
PITPNA-211	ENST00000576761	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PITPNA-211	ENST00000576761	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PITPNA-211	ENST00000576761	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.32	■■■■■ 4.21
PITPNA-211	ENST00000576761	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		41.31	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		41.29	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		41.28	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		41.28	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	41.28	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		41.28	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	MLEC	Q14165	292 aa		41.27	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.27	■■■■■ 4.2
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCA6	Q8N139	1617 aa		41.24	■■■■■ 4.19
PITPNA-211	ENST00000576761	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.23	■■■■■ 4.19
PITPNA-211	ENST00000576761	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	41.22	■■■■■ 4.19
PITPNA-211	ENST00000576761	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		41.2	■■■■■ 4.19
PITPNA-211	ENST00000576761	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		41.18	■■■■■ 4.18
PITPNA-211	ENST00000576761	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		41.17	■■■■■ 4.18
PITPNA-211	ENST00000576761	TIAM1	Q13009	1591 aa		41.16	■■■■■ 4.18
PITPNA-211	ENST00000576761	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		41.15	■■■■■ 4.18
PITPNA-211	ENST00000576761	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.13	■■■■■ 4.17
PITPNA-211	ENST00000576761	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	41.12	■■■■■ 4.17	2e-7	■■■■□ 19.7
PITPNA-211	ENST00000576761	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.08	■■■■■ 4.17
PITPNA-211	ENST00000576761	AGL	P35573	1532 aa		41.08	■■■■■ 4.17
PITPNA-211	ENST00000576761	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	41.07	■■■■■ 4.17
PITPNA-211	ENST00000576761	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	41.06	■■■■■ 4.16
PITPNA-211	ENST00000576761	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.05	■■■■■ 4.16
PITPNA-211	ENST00000576761	NCOA2	Q15596	1464 aa		41.01	■■■■■ 4.16
PITPNA-211	ENST00000576761	ATP7A	Q04656	1500 aa		41	■■■■■ 4.15
PITPNA-211	ENST00000576761	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
PITPNA-211	ENST00000576761	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.95	■■■■■ 4.15
PITPNA-211	ENST00000576761	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.92	■■■■■ 4.14
PITPNA-211	ENST00000576761	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PITPNA-211	ENST00000576761	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.89	■■■■■ 4.14
PITPNA-211	ENST00000576761	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.13
PITPNA-211	ENST00000576761	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
PITPNA-211	ENST00000576761	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.85	■■■■■ 4.13
PITPNA-211	ENST00000576761	A2M	P01023	1474 aa		40.83	■■■■■ 4.13
PITPNA-211	ENST00000576761	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.83	■■■■■ 4.13
PITPNA-211	ENST00000576761	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.83	■■■■■ 4.13
PITPNA-211	ENST00000576761	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.83	■■■■■ 4.13
PITPNA-211	ENST00000576761	C3	P01024	1663 aa		40.82	■■■■■ 4.12
PITPNA-211	ENST00000576761	HSPA2	P54652	639 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PITPNA-211	ENST00000576761	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PITPNA-211	ENST00000576761	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
PITPNA-211	ENST00000576761	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.79	■■■■■ 4.12
PITPNA-211	ENST00000576761	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.77	■■■■■ 4.12
PITPNA-211	ENST00000576761	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
PITPNA-211	ENST00000576761	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PITPNA-211	ENST00000576761	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.72	■■■■■ 4.11
PITPNA-211	ENST00000576761	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.69	■■■■■ 4.1
PITPNA-211	ENST00000576761	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PITPNA-211	ENST00000576761	APLP2	Q06481	763 aa		40.65	■■■■■ 4.1
PITPNA-211	ENST00000576761	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	GGT6	Q6P531	493 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.59	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.59	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.57	■■■■■ 4.09
PITPNA-211	ENST00000576761	NPAT	Q14207	1427 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PITPNA-211	ENST00000576761	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PITPNA-211	ENST00000576761	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.46	■■■■■ 4.07
PITPNA-211	ENST00000576761	KIF3B	O15066	747 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PITPNA-211	ENST00000576761	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PITPNA-211	ENST00000576761	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PITPNA-211	ENST00000576761	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PITPNA-211	ENST00000576761	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.37	■■■■■ 4.05
PITPNA-211	ENST00000576761	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PITPNA-211	ENST00000576761	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PITPNA-211	ENST00000576761	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PITPNA-211	ENST00000576761	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.31	■■■■■ 4.04

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