RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573850.1

KIAA0556-209, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 5

Gene KIAA0556, Length 3,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-209ENST00000573850 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.62■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 NAIPQ13075 1403 aa15.61■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 MIA2Q96PC5 1412 aa15.6■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
KIAA0556-209ENST00000573850 CHD1O14646 1710 aa15.58■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 NBR1Q14596 966 aa15.56■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 UACAQ9BZF9 1416 aa15.55■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.54■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 PTPRGP23470 1445 aa15.53■□□□□ 0.08
KIAA0556-209ENST00000573850 KIF14Q15058 1648 aa15.52■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 ABCA8O94911 1581 aa15.51■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 DAPK1P53355 1430 aa15.51■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 ATP10BO94823 1461 aa15.5■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 KDM6BO15054 1643 aa15.49■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.49■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 ABCC5O15440 1437 aa15.48■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 TONSLQ96HA7 1378 aa15.48■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.47■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.46■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.46■□□□□ 0.07
KIAA0556-209ENST00000573850 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.46■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 AKNAQ7Z591 1439 aa15.45■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.45■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 FOXD1Q16676 465 aa15.43■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.43■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.42■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 ROCK1Q13464 1354 aa15.42■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 IL27Q8NEV9 243 aa15.4■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 SHROOM2Q13796 1616 aa15.4■□□□□ 0.06
KIAA0556-209ENST00000573850 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.39■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.38■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 NCOA1Q15788 1441 aa15.35■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.33■□□□□ 0.05
KIAA0556-209ENST00000573850 TSPY4P0CV99 314 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 TSPY10P0CW01 314 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.32■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 ABCC2Q92887 1545 aa15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.3■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 ADGRL2O95490 1459 aa15.29■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.28■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.28■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.27■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.27■□□□□ 0.04
KIAA0556-209ENST00000573850 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.27■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 PREX2Q70Z35 1606 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 ANP32CO43423 234 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 PZPP20742 1482 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 PKD2Q13563 968 aa15.24■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 NUP155O75694 1391 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 KIF15Q9NS87 1388 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 MBD5Q9P267 1494 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.22■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-209ENST00000573850 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.18■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.15■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
KIAA0556-209ENST00000573850 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.14■□□□□ 0.01
KIAA0556-209ENST00000573850 CCER2I3L3R5 266 aa15.14■□□□□ 0.01
KIAA0556-209ENST00000573850 PLCH2O75038 1416 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms