RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
RNPS1-222	ENST00000567147	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RNPS1-222	ENST00000567147	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RNPS1-222	ENST00000567147	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RNPS1-222	ENST00000567147	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
RNPS1-222	ENST00000567147	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RNPS1-222	ENST00000567147	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RNPS1-222	ENST00000567147	PLCH2	O75038	1416 aa		28.51	■■■□□ 2.15
RNPS1-222	ENST00000567147	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP10A	O60312	1499 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RNPS1-222	ENST00000567147	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RNPS1-222	ENST00000567147	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.45	■■■□□ 2.14
RNPS1-222	ENST00000567147	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.44	■■■□□ 2.14
RNPS1-222	ENST00000567147	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.43	■■■□□ 2.14
RNPS1-222	ENST00000567147	KIF14	Q15058	1648 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RNPS1-222	ENST00000567147	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RNPS1-222	ENST00000567147	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
RNPS1-222	ENST00000567147	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RNPS1-222	ENST00000567147	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.35	■■■□□ 2.13
RNPS1-222	ENST00000567147	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.35	■■■□□ 2.13
RNPS1-222	ENST00000567147	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.33	■■■□□ 2.13
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.31	■■■□□ 2.12
RNPS1-222	ENST00000567147	CLIP1	P30622	1438 aa		28.29	■■■□□ 2.12
RNPS1-222	ENST00000567147	KDM5C	P41229	1560 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RNPS1-222	ENST00000567147	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RNPS1-222	ENST00000567147	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RNPS1-222	ENST00000567147	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RNPS1-222	ENST00000567147	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.26	■■■□□ 2.12
RNPS1-222	ENST00000567147	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.26	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	C3	P01024	1663 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RNPS1-222	ENST00000567147	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RNPS1-222	ENST00000567147	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RNPS1-222	ENST00000567147	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
RNPS1-222	ENST00000567147	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.14	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCC1	P33527	1531 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	PTPRT	O14522	1441 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	AGL	P35573	1532 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RNPS1-222	ENST00000567147	SOCS7	O14512	581 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RNPS1-222	ENST00000567147	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RNPS1-222	ENST00000567147	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RNPS1-222	ENST00000567147	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RNPS1-222	ENST00000567147	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RNPS1-222	ENST00000567147	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.01	■■■□□ 2.08
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
RNPS1-222	ENST00000567147	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RNPS1-222	ENST00000567147	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RNPS1-222	ENST00000567147	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
RNPS1-222	ENST00000567147	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RNPS1-222	ENST00000567147	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.91	■■■□□ 2.06	2e-9	■■■□□ 17.5
RNPS1-222	ENST00000567147	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	NPAT	Q14207	1427 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RNPS1-222	ENST00000567147	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
RNPS1-222	ENST00000567147	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RNPS1-222	ENST00000567147	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RNPS1-222	ENST00000567147	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	GGT6	Q6P531	493 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	A2M	P01023	1474 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.76	■■■□□ 2.04
RNPS1-222	ENST00000567147	PLA2R1	Q13018	1463 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RNPS1-222	ENST00000567147	PKD2	Q13563	968 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RNPS1-222	ENST00000567147	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RNPS1-222	ENST00000567147	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RNPS1-222	ENST00000567147	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RNPS1-222	ENST00000567147	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RNPS1-222	ENST00000567147	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
RNPS1-222	ENST00000567147	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RNPS1-222	ENST00000567147	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RNPS1-222	ENST00000567147	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
RNPS1-222	ENST00000567147	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
RNPS1-222	ENST00000567147	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RNPS1-222	ENST00000567147	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RNPS1-222	ENST00000567147	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.61	■■■□□ 2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms