RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560514.1

TSPAN3-208, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-208ENST00000560514 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.86■■■□□ 2.37
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TSPAN3-208ENST00000560514 ATP10AO60312 1499 aa29.8■■■□□ 2.36
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TSPAN3-208ENST00000560514 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.79■■■□□ 2.36
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TSPAN3-208ENST00000560514 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.75■■■□□ 2.35
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TSPAN3-208ENST00000560514 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
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TSPAN3-208ENST00000560514 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.66■■■□□ 2.34
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TSPAN3-208ENST00000560514 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.58■■■□□ 2.33
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TSPAN3-208ENST00000560514 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.48■■■□□ 2.31
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TSPAN3-208ENST00000560514 SOCS7O14512 581 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPAN3-208ENST00000560514 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.45■■■□□ 2.31
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TSPAN3-208ENST00000560514 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.42■■■□□ 2.3
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TSPAN3-208ENST00000560514 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.35■■■□□ 2.29
TSPAN3-208ENST00000560514 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.32■■■□□ 2.28
TSPAN3-208ENST00000560514 NCOA1Q15788 1441 aa29.32■■■□□ 2.28
TSPAN3-208ENST00000560514 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.31■■■□□ 2.28
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TSPAN3-208ENST00000560514 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.24■■■□□ 2.27
TSPAN3-208ENST00000560514 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.22■■■□□ 2.27
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TSPAN3-208ENST00000560514 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.15■■■□□ 2.26
TSPAN3-208ENST00000560514 PKD2Q13563 968 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPAN3-208ENST00000560514 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
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TSPAN3-208ENST00000560514 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPAN3-208ENST00000560514 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
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TSPAN3-208ENST00000560514 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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TSPAN3-208ENST00000560514 CPS1P31327 1500 aa28.83■■■□□ 2.21
TSPAN3-208ENST00000560514 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
TSPAN3-208ENST00000560514 TNRQ92752 1358 aa28.8■■■□□ 2.2
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