RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-208ENST00000559642 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.67■□□□□ 0.9
BMP4-208ENST00000559642 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.65■□□□□ 0.9
BMP4-208ENST00000559642 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.64■□□□□ 0.9
BMP4-208ENST00000559642 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.63■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.63■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.62■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.62■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.62■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.61■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 ABCC1P33527 1531 aa20.58■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.58■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.58■□□□□ 0.89
BMP4-208ENST00000559642 TIAM1Q13009 1591 aa20.58■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.57■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.55■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.55■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.54■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 KDM5CP41229 1560 aa20.54■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.53■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.52■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.52■□□□□ 0.88
BMP4-208ENST00000559642 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.51■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.51■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.5■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.5■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.49■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 AFAP1Q8N556 730 aa20.48■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 NCOA2Q15596 1464 aa20.47■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 ABCA6Q8N139 1617 aa20.46■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 MADDQ8WXG6 1647 aa20.46■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.46■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.46■□□□□ 0.87
BMP4-208ENST00000559642 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.44■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 MAP3K1Q13233 1512 aa20.43■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 ATP10AO60312 1499 aa20.43■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.42■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.42■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.41■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.41■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
BMP4-208ENST00000559642 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.38■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 REREQ9P2R6 1566 aa20.37■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 PTPRMP28827 1452 aa20.37■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.36■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.36■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 ATP7AQ04656 1500 aa20.35■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 MLECQ14165 292 aa20.34■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 MBD5Q9P267 1494 aa20.33■□□□□ 0.85
BMP4-208ENST00000559642 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
BMP4-208ENST00000559642 APLP2Q06481 763 aa20.29■□□□□ 0.84
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BMP4-208ENST00000559642 AGLP35573 1532 aa20.27■□□□□ 0.84
BMP4-208ENST00000559642 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.27■□□□□ 0.84
BMP4-208ENST00000559642 PLXNC1O60486 1568 aa20.25■□□□□ 0.83
BMP4-208ENST00000559642 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.25■□□□□ 0.83
BMP4-208ENST00000559642 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.25■□□□□ 0.83
BMP4-208ENST00000559642 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.23■□□□□ 0.83
BMP4-208ENST00000559642 A2MP01023 1474 aa20.23■□□□□ 0.83
BMP4-208ENST00000559642 MIA2Q96PC5 1412 aa20.21■□□□□ 0.83
BMP4-208ENST00000559642 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.19■□□□□ 0.82
BMP4-208ENST00000559642 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.19■□□□□ 0.82
BMP4-208ENST00000559642 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.16■□□□□ 0.82
BMP4-208ENST00000559642 C3P01024 1663 aa20.16■□□□□ 0.82
BMP4-208ENST00000559642 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.15■□□□□ 0.82
BMP4-208ENST00000559642 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.14■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.14■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.12■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 MROH2AA6NES4 1674 aa20.1■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.1■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.09■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 TSPY4P0CV99 314 aa20.08■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 TSPY10P0CW01 314 aa20.08■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
BMP4-208ENST00000559642 ABCC5O15440 1437 aa20.07■□□□□ 0.8
BMP4-208ENST00000559642 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.06■□□□□ 0.8
BMP4-208ENST00000559642 GGT6Q6P531 493 aa20.06■□□□□ 0.8
BMP4-208ENST00000559642 DAPK1P53355 1430 aa20.05■□□□□ 0.8
BMP4-208ENST00000559642 KIF3BO15066 747 aa20.02■□□□□ 0.8
BMP4-208ENST00000559642 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
BMP4-208ENST00000559642 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
BMP4-208ENST00000559642 HSPA2P54652 639 aa20.01■□□□□ 0.79
BMP4-208ENST00000559642 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
BMP4-208ENST00000559642 KDM5DQ9BY66 1539 aa20■□□□□ 0.79
BMP4-208ENST00000559642 ZMYM3Q14202 1370 aa19.99■□□□□ 0.79
BMP4-208ENST00000559642 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.99■□□□□ 0.79
BMP4-208ENST00000559642 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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