RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559432.5

CRNDE-206, Transcript of colorectal neoplasia differentially expressed, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CRNDE, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNDE-206ENST00000559432 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.62■■■■■ 4.09
CRNDE-206ENST00000559432 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.61■■■■■ 4.09
CRNDE-206ENST00000559432 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.58■■■■■ 4.09
CRNDE-206ENST00000559432 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.57■■■■■ 4.09
CRNDE-206ENST00000559432 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.53■■■■■ 4.08
CRNDE-206ENST00000559432 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.51■■■■■ 4.08
CRNDE-206ENST00000559432 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.5■■■■■ 4.07
CRNDE-206ENST00000559432 CEP162Q5TB80 1403 aa40.49■■■■■ 4.07
CRNDE-206ENST00000559432 PREX2Q70Z35 1606 aa40.45■■■■■ 4.07
CRNDE-206ENST00000559432 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.45■■■■■ 4.07
CRNDE-206ENST00000559432 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.45■■■■■ 4.07
CRNDE-206ENST00000559432 PTPRMP28827 1452 aa40.43■■■■■ 4.06
CRNDE-206ENST00000559432 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.41■■■■■ 4.06
CRNDE-206ENST00000559432 MADDQ8WXG6 1647 aa40.39■■■■■ 4.06
CRNDE-206ENST00000559432 AFAP1Q8N556 730 aa40.38■■■■■ 4.05
CRNDE-206ENST00000559432 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.36■■■■■ 4.05
CRNDE-206ENST00000559432 ATP10AO60312 1499 aa40.36■■■■■ 4.05
CRNDE-206ENST00000559432 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.34■■■■■ 4.05
CRNDE-206ENST00000559432 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.33■■■■■ 4.05
CRNDE-206ENST00000559432 KDM5CP41229 1560 aa40.33■■■■■ 4.05
CRNDE-206ENST00000559432 ABCC1P33527 1531 aa40.32■■■■■ 4.05
CRNDE-206ENST00000559432 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.32■■■■■ 4.04
CRNDE-206ENST00000559432 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.29■■■■■ 4.04
CRNDE-206ENST00000559432 MLECQ14165 292 aa40.27■■■■■ 4.04
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CRNDE-206ENST00000559432 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.26■■■■■ 4.04
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CRNDE-206ENST00000559432 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.25■■■■■ 4.03
CRNDE-206ENST00000559432 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.24■■■■■ 4.03
CRNDE-206ENST00000559432 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.23■■■■■ 4.03
CRNDE-206ENST00000559432 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.22■■■■■ 4.03
CRNDE-206ENST00000559432 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CRNDE-206ENST00000559432 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.19■■■■■ 4.02
CRNDE-206ENST00000559432 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.17■■■■■ 4.02
CRNDE-206ENST00000559432 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.17■■■■■ 4.02
CRNDE-206ENST00000559432 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.12■■■■■ 4.01
CRNDE-206ENST00000559432 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
CRNDE-206ENST00000559432 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.11■■■■■ 4.01
CRNDE-206ENST00000559432 ABCA6Q8N139 1617 aa40.11■■■■■ 4.01
CRNDE-206ENST00000559432 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.11■■■■■ 4.01
CRNDE-206ENST00000559432 REREQ9P2R6 1566 aa40.09■■■■■ 4.01
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CRNDE-206ENST00000559432 AGLP35573 1532 aa39.97■■■■□ 3.99
CRNDE-206ENST00000559432 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.97■■■■□ 3.99
CRNDE-206ENST00000559432 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
CRNDE-206ENST00000559432 NCOA2Q15596 1464 aa39.93■■■■□ 3.98
CRNDE-206ENST00000559432 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
CRNDE-206ENST00000559432 ATP7AQ04656 1500 aa39.91■■■■□ 3.98
CRNDE-206ENST00000559432 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
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CRNDE-206ENST00000559432 HSPA2P54652 639 aa39.79■■■■□ 3.96
CRNDE-206ENST00000559432 MAP3K1Q13233 1512 aa39.77■■■■□ 3.96
CRNDE-206ENST00000559432 A2MP01023 1474 aa39.77■■■■□ 3.96
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CRNDE-206ENST00000559432 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.74■■■■□ 3.95
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CRNDE-206ENST00000559432 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.71■■■■□ 3.95
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CRNDE-206ENST00000559432 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
CRNDE-206ENST00000559432 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.7■■■■□ 3.95
CRNDE-206ENST00000559432 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.69■■■■□ 3.94
CRNDE-206ENST00000559432 C3P01024 1663 aa39.68■■■■□ 3.94
CRNDE-206ENST00000559432 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.68■■■■□ 3.94
CRNDE-206ENST00000559432 APLP2Q06481 763 aa39.67■■■■□ 3.94
CRNDE-206ENST00000559432 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.65■■■■□ 3.94
CRNDE-206ENST00000559432 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
CRNDE-206ENST00000559432 GGT6Q6P531 493 aa39.6■■■■□ 3.93
CRNDE-206ENST00000559432 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.58■■■■□ 3.93
CRNDE-206ENST00000559432 TSPY4P0CV99 314 aa39.57■■■■□ 3.93
CRNDE-206ENST00000559432 TSPY10P0CW01 314 aa39.57■■■■□ 3.93
CRNDE-206ENST00000559432 MROH2AA6NES4 1674 aa39.57■■■■□ 3.92
CRNDE-206ENST00000559432 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
CRNDE-206ENST00000559432 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.55■■■■□ 3.92
CRNDE-206ENST00000559432 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
CRNDE-206ENST00000559432 ZMYM3Q14202 1370 aa39.54■■■■□ 3.92
CRNDE-206ENST00000559432 MIA2Q96PC5 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
CRNDE-206ENST00000559432 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.52■■■■□ 3.92
CRNDE-206ENST00000559432 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.91
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CRNDE-206ENST00000559432 KIF3BO15066 747 aa39.44■■■■□ 3.9
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CRNDE-206ENST00000559432 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.38■■■■□ 3.89
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CRNDE-206ENST00000559432 STRCQ7RTU9 1775 aa39.31■■■■□ 3.88
CRNDE-206ENST00000559432 FBXO41Q8TF61 875 aa39.3■■■■□ 3.88
CRNDE-206ENST00000559432 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.3■■■■□ 3.88
CRNDE-206ENST00000559432 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.28■■■■□ 3.88
CRNDE-206ENST00000559432 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.28■■■■□ 3.88
CRNDE-206ENST00000559432 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.26■■■■□ 3.88
CRNDE-206ENST00000559432 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.23■■■■□ 3.87
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