RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 ILDR2Q71H61 639 aa32.61■■■□□ 2.81
SEMA4B-211ENST00000559322 SOCS7O14512 581 aa32.59■■■□□ 2.81
SEMA4B-211ENST00000559322 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.59■■■□□ 2.81
SEMA4B-211ENST00000559322 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.57■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.57■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.55■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP10AO60312 1499 aa32.54■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.52■■■□□ 2.8
SEMA4B-211ENST00000559322 PLCH2O75038 1416 aa32.51■■■□□ 2.79
SEMA4B-211ENST00000559322 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
SEMA4B-211ENST00000559322 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.45■■■□□ 2.79
SEMA4B-211ENST00000559322 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.43■■■□□ 2.78
SEMA4B-211ENST00000559322 STRCQ7RTU9 1775 aa32.42■■■□□ 2.78
SEMA4B-211ENST00000559322 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.39■■■□□ 2.78
SEMA4B-211ENST00000559322 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.38■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 EEA1Q15075 1411 aa32.36■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.34■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.34■■■□□ 2.77
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPRTO14522 1441 aa32.31■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 AFAP1Q8N556 730 aa32.29■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.26■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 KDM5CP41229 1560 aa32.24■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 KIF14Q15058 1648 aa32.22■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.21■■■□□ 2.75
SEMA4B-211ENST00000559322 C3P01024 1663 aa32.2■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 FMN1Q68DA7 1419 aa32.19■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 REREQ9P2R6 1566 aa32.18■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.17■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.17■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.16■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 CLIP1P30622 1438 aa32.15■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCA6Q8N139 1617 aa32.13■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.12■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 NCOA1Q15788 1441 aa32.11■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 AGLP35573 1532 aa32.1■■■□□ 2.73
SEMA4B-211ENST00000559322 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
SEMA4B-211ENST00000559322 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.06■■■□□ 2.72
SEMA4B-211ENST00000559322 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.06■■■□□ 2.72
SEMA4B-211ENST00000559322 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.01■■■□□ 2.72
SEMA4B-211ENST00000559322 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.99■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 ABCC1P33527 1531 aa31.99■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 NPATQ14207 1427 aa31.96■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 PREX2Q70Z35 1606 aa31.95■■■□□ 2.71
SEMA4B-211ENST00000559322 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.95■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.95■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.91■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 ZMYM3Q14202 1370 aa31.91■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 MROH2AA6NES4 1674 aa31.89■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.89■■■□□ 2.7
SEMA4B-211ENST00000559322 PKD2Q13563 968 aa31.85■■■□□ 2.69
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
SEMA4B-211ENST00000559322 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.81■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 PLA2R1Q13018 1463 aa31.8■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.8■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.78■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.77■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
SEMA4B-211ENST00000559322 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.75■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.73■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.72■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.71■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPRKQ15262 1439 aa31.71■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 GGT6Q6P531 493 aa31.7■■■□□ 2.67
SEMA4B-211ENST00000559322 PIP4K2BP78356 416 aa31.68■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP7AQ04656 1500 aa31.68■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 A2MP01023 1474 aa31.67■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 HSPA1LP34931 641 aa31.67■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 PLXNC1O60486 1568 aa31.64■■■□□ 2.66
SEMA4B-211ENST00000559322 TOM1O60784 492 aa31.63■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.59■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.59■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.58■■■□□ 2.65
SEMA4B-211ENST00000559322 CPS1P31327 1500 aa31.55■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.55■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
SEMA4B-211ENST00000559322 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.51■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.5■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.49■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
SEMA4B-211ENST00000559322 TNRQ92752 1358 aa31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms