RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
NEK9-211ENST00000557673 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.22■■□□□ 1.95
NEK9-211ENST00000557673 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.22■■□□□ 1.95
NEK9-211ENST00000557673 HECW1Q76N89 1606 aa27.19■■□□□ 1.94
NEK9-211ENST00000557673 MLECQ14165 292 aa27.16■■□□□ 1.94
NEK9-211ENST00000557673 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.16■■□□□ 1.94
NEK9-211ENST00000557673 ATP10AO60312 1499 aa27.13■■□□□ 1.93
NEK9-211ENST00000557673 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.13■■□□□ 1.93
NEK9-211ENST00000557673 HSPA2P54652 639 aa27.11■■□□□ 1.93
NEK9-211ENST00000557673 CLIP1P30622 1438 aa27.1■■□□□ 1.93
NEK9-211ENST00000557673 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.1■■□□□ 1.93
NEK9-211ENST00000557673 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.09■■□□□ 1.93
NEK9-211ENST00000557673 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
NEK9-211ENST00000557673 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.07■■□□□ 1.92
NEK9-211ENST00000557673 KIF14Q15058 1648 aa27.07■■□□□ 1.92
NEK9-211ENST00000557673 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.07■■□□□ 1.92
NEK9-211ENST00000557673 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.04■■□□□ 1.92
NEK9-211ENST00000557673 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.03■■□□□ 1.92
NEK9-211ENST00000557673 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.03■■□□□ 1.92
NEK9-211ENST00000557673 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.03■■□□□ 1.92
NEK9-211ENST00000557673 AFAP1Q8N556 730 aa27.01■■□□□ 1.91
NEK9-211ENST00000557673 KDM5CP41229 1560 aa26.96■■□□□ 1.91
NEK9-211ENST00000557673 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 CERKQ8TCT0 537 aa26.93■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.93■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.92■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.91■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.9■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.89■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
NEK9-211ENST00000557673 REREQ9P2R6 1566 aa26.88■■□□□ 1.89
NEK9-211ENST00000557673 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.86■■□□□ 1.89
NEK9-211ENST00000557673 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.86■■□□□ 1.89
NEK9-211ENST00000557673 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.86■■□□□ 1.89
NEK9-211ENST00000557673 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.85■■□□□ 1.89
NEK9-211ENST00000557673 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
NEK9-211ENST00000557673 PREX2Q70Z35 1606 aa26.83■■□□□ 1.89
NEK9-211ENST00000557673 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
NEK9-211ENST00000557673 ABCC1P33527 1531 aa26.81■■□□□ 1.88
NEK9-211ENST00000557673 AGLP35573 1532 aa26.81■■□□□ 1.88
NEK9-211ENST00000557673 ABCA6Q8N139 1617 aa26.79■■□□□ 1.88
NEK9-211ENST00000557673 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.78■■□□□ 1.88
NEK9-211ENST00000557673 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.75■■□□□ 1.87
NEK9-211ENST00000557673 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.75■■□□□ 1.87
NEK9-211ENST00000557673 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
NEK9-211ENST00000557673 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.7■■□□□ 1.87
NEK9-211ENST00000557673 C3P01024 1663 aa26.7■■□□□ 1.87
NEK9-211ENST00000557673 STRCQ7RTU9 1775 aa26.7■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.69■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 PTPRTO14522 1441 aa26.68■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.67■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.65■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.65■■□□□ 1.86
NEK9-211ENST00000557673 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.62■■□□□ 1.85
NEK9-211ENST00000557673 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.62■■□□□ 1.85
NEK9-211ENST00000557673 NPATQ14207 1427 aa26.62■■□□□ 1.85
NEK9-211ENST00000557673 CEP162Q5TB80 1403 aa26.62■■□□□ 1.85
NEK9-211ENST00000557673 ZMYM3Q14202 1370 aa26.59■■□□□ 1.85
NEK9-211ENST00000557673 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.58■■□□□ 1.85
NEK9-211ENST00000557673 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.57■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 MROH2AA6NES4 1674 aa26.57■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 NCOA1Q15788 1441 aa26.56■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 ATP7AQ04656 1500 aa26.56■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 ILDR2Q71H61 639 aa26.55■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.55■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.54■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 A2MP01023 1474 aa26.54■■□□□ 1.84
NEK9-211ENST00000557673 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NEK9-211ENST00000557673 GGT6Q6P531 493 aa26.5■■□□□ 1.83
NEK9-211ENST00000557673 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
NEK9-211ENST00000557673 PLXNC1O60486 1568 aa26.49■■□□□ 1.83
NEK9-211ENST00000557673 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
NEK9-211ENST00000557673 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.48■■□□□ 1.83
NEK9-211ENST00000557673 PKD2Q13563 968 aa26.46■■□□□ 1.83
NEK9-211ENST00000557673 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.46■■□□□ 1.83
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NEK9-211ENST00000557673 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.42■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 PTPRKQ15262 1439 aa26.42■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.41■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.41■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 PLA2R1Q13018 1463 aa26.41■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.41■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 SOCS7O14512 581 aa26.4■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 MBD5Q9P267 1494 aa26.39■■□□□ 1.82
NEK9-211ENST00000557673 TIAM1Q13009 1591 aa26.38■■□□□ 1.81
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NEK9-211ENST00000557673 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.37■■□□□ 1.81
NEK9-211ENST00000557673 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.36■■□□□ 1.81
NEK9-211ENST00000557673 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
NEK9-211ENST00000557673 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
NEK9-211ENST00000557673 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NEK9-211ENST00000557673 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NEK9-211ENST00000557673 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.33■■□□□ 1.8
NEK9-211ENST00000557673 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.31■■□□□ 1.8
NEK9-211ENST00000557673 KIF3BO15066 747 aa26.3■■□□□ 1.8
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