RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.32■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.32■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.31■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.31■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.3■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.29■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.28■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 PREX2Q70Z35 1606 aa22.27■■□□□ 1.16
PCNX4-209ENST00000555569 CEP162Q5TB80 1403 aa22.24■■□□□ 1.15
PCNX4-209ENST00000555569 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.24■■□□□ 1.15
PCNX4-209ENST00000555569 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.23■■□□□ 1.15
PCNX4-209ENST00000555569 MADDQ8WXG6 1647 aa22.23■■□□□ 1.15
PCNX4-209ENST00000555569 PTPRMP28827 1452 aa22.22■■□□□ 1.15
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.22■■□□□ 1.15
PCNX4-209ENST00000555569 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.21■■□□□ 1.15
PCNX4-209ENST00000555569 KDM5CP41229 1560 aa22.2■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 ABCC1P33527 1531 aa22.18■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 ATP10AO60312 1499 aa22.17■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 AFAP1Q8N556 730 aa22.17■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.17■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.15■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.14■■□□□ 1.14
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.14■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.13■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.13■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.12■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.1■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 MLECQ14165 292 aa22.1■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.1■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.1■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.1■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.09■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.09■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 ABCA6Q8N139 1617 aa22.08■■□□□ 1.13
PCNX4-209ENST00000555569 REREQ9P2R6 1566 aa22.06■■□□□ 1.12
PCNX4-209ENST00000555569 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.06■■□□□ 1.12
PCNX4-209ENST00000555569 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.05■■□□□ 1.12
PCNX4-209ENST00000555569 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PCNX4-209ENST00000555569 TIAM1Q13009 1591 aa22.04■■□□□ 1.12
PCNX4-209ENST00000555569 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.03■■□□□ 1.12
PCNX4-209ENST00000555569 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.01■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.01■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 VPS8Q8N3P4 1428 aa22■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 AGLP35573 1532 aa21.99■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.97■■□□□ 1.11
PCNX4-209ENST00000555569 NCOA2Q15596 1464 aa21.94■■□□□ 1.1
PCNX4-209ENST00000555569 ATP7AQ04656 1500 aa21.94■■□□□ 1.1
PCNX4-209ENST00000555569 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PCNX4-209ENST00000555569 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.9■■□□□ 1.1
PCNX4-209ENST00000555569 MBD5Q9P267 1494 aa21.9■■□□□ 1.1
PCNX4-209ENST00000555569 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 MAP3K1Q13233 1512 aa21.87■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.86■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 C3P01024 1663 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 A2MP01023 1474 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 HSPA2P54652 639 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 PLXNC1O60486 1568 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.83■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PCNX4-209ENST00000555569 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.82■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 MROH2AA6NES4 1674 aa21.79■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.79■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.78■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.78■■□□□ 1.08
PCNX4-209ENST00000555569 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PCNX4-209ENST00000555569 APLP2Q06481 763 aa21.74■■□□□ 1.07
PCNX4-209ENST00000555569 GGT6Q6P531 493 aa21.74■■□□□ 1.07
PCNX4-209ENST00000555569 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PCNX4-209ENST00000555569 ZMYM3Q14202 1370 aa21.72■■□□□ 1.07
PCNX4-209ENST00000555569 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.72■■□□□ 1.07
PCNX4-209ENST00000555569 MIA2Q96PC5 1412 aa21.71■■□□□ 1.07
PCNX4-209ENST00000555569 TSPY4P0CV99 314 aa21.7■■□□□ 1.06
PCNX4-209ENST00000555569 TSPY10P0CW01 314 aa21.7■■□□□ 1.06
PCNX4-209ENST00000555569 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.7■■□□□ 1.06
PCNX4-209ENST00000555569 NPATQ14207 1427 aa21.7■■□□□ 1.06
PCNX4-209ENST00000555569 STRCQ7RTU9 1775 aa21.67■■□□□ 1.06
PCNX4-209ENST00000555569 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.66■■□□□ 1.06
PCNX4-209ENST00000555569 KIF3BO15066 747 aa21.65■■□□□ 1.06
PCNX4-209ENST00000555569 PTPRKQ15262 1439 aa21.62■■□□□ 1.05
PCNX4-209ENST00000555569 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.61■■□□□ 1.05
PCNX4-209ENST00000555569 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.6■■□□□ 1.05
PCNX4-209ENST00000555569 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.6■■□□□ 1.05
PCNX4-209ENST00000555569 FBXO41Q8TF61 875 aa21.59■■□□□ 1.05
PCNX4-209ENST00000555569 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.59■■□□□ 1.05
PCNX4-209ENST00000555569 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms