RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 FANCAO15360 1455 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 RICTORQ6R327 1708 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 AKNAQ7Z591 1439 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 ABCC1P33527 1531 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 KDM5CP41229 1560 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-213ENST00000548746 ARHGAP5Q13017 1502 aa9.4□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 ADGRL1O94910 1474 aa9.4□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 NCOA2Q15596 1464 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-213ENST00000548746 REREQ9P2R6 1566 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 RAPGEF3O95398 923 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 MIA2Q96PC5 1412 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 MBD5Q9P267 1494 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 ABCA6Q8N139 1617 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 ATP10AO60312 1499 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 APLP2Q06481 763 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-213ENST00000548746 AGLP35573 1532 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 ATP7AQ04656 1500 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 AFAP1Q8N556 730 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 PLXNC1O60486 1568 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 MSH5O43196 834 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 MADDQ8WXG6 1647 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-213ENST00000548746 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 A2MP01023 1474 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 ABCC5O15440 1437 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 DAPK1P53355 1430 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 ADGRL2O95490 1459 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 PTPRMP28827 1452 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 MROH2AA6NES4 1674 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 TSPY4P0CV99 314 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 TSPY10P0CW01 314 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-213ENST00000548746 ERBINQ96RT1 1412 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 DEPDC5O75140 1603 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-213ENST00000548746 NCOA1Q15788 1441 aa9.14□□□□□ -0.95
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