RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, humanhuman

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2-208ENST00000547541 ROCK1Q13464 1354 aa14.98□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.98□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.97□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.97□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.97□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 DAPK1P53355 1430 aa14.97□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 ABCC5O15440 1437 aa14.96□□□□□ -0.01
TARBP2-208ENST00000547541 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 PLCH2O75038 1416 aa14.95□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 KCNH8Q96L42 1107 aa14.95□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 PREX2Q70Z35 1606 aa14.95□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.93□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.93□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 NAIPQ13075 1403 aa14.92□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 ASXL2Q76L83 1435 aa14.92□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.92□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.92□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.9□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.9□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.9□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.9□□□□□ -0.02
TARBP2-208ENST00000547541 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.89□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 TSPY4P0CV99 314 aa14.89□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 TSPY10P0CW01 314 aa14.89□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 ADGRL2O95490 1459 aa14.89□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 MBD5Q9P267 1494 aa14.89□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.89□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.88□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.88□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.87□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.86□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.86□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 NCOA1Q15788 1441 aa14.86□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.86□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 MAPKBP1O60336 1514 aa14.85□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.84□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.84□□□□□ -0.03
TARBP2-208ENST00000547541 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.83□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.82□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.81□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 ABCC1P33527 1531 aa14.78□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.78□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 FANCAO15360 1455 aa14.78□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 CD109Q6YHK3 1445 aa14.78□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.78□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.77□□□□□ -0.04
TARBP2-208ENST00000547541 GLI2P10070 1586 aa14.77□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.76□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.75□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.75□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 TRIM52Q96A61 297 aa14.74□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 KIF15Q9NS87 1388 aa14.73□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 ADGRL1O94910 1474 aa14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 NEO1Q92859 1461 aa14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 KDM6BO15054 1643 aa14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 PLXNC1O60486 1568 aa14.72□□□□□ -0.05
TARBP2-208ENST00000547541 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.69□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.68□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 AFAP1Q8N556 730 aa14.67□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 ERBINQ96RT1 1412 aa14.66□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.66□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.66□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.66□□□□□ -0.06
TARBP2-208ENST00000547541 DIP2BQ9P265 1576 aa14.64□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 PZPP20742 1482 aa14.63□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 NUP155O75694 1391 aa14.63□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.63□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.62□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.62□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.62□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 ATP7AQ04656 1500 aa14.61□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.61□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.61□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 KDM5CP41229 1560 aa14.6□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 NEUROD1Q13562 356 aa14.6□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 UNC13BO14795 1591 aa14.59□□□□□ -0.07
TARBP2-208ENST00000547541 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.58□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.57□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 PKD2Q13563 968 aa14.57□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 TONSLQ96HA7 1378 aa14.57□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.55□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.54□□□□□ -0.08
TARBP2-208ENST00000547541 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms