RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 ARID3CA6NKF2 412 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 ABCA8O94911 1581 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 DSG3P32926 999 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-204ENST00000546621 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.41□□□□□ -0.58
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CS-204ENST00000546621 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.39□□□□□ -0.59
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CS-204ENST00000546621 SLC24A1O60721 1099 aa11.37□□□□□ -0.59
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CS-204ENST00000546621 OSCARQ8IYS5 282 aa11.36□□□□□ -0.59
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CS-204ENST00000546621 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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CS-204ENST00000546621 NEUROD1Q13562 356 aa11.35□□□□□ -0.59
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CS-204ENST00000546621 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.34□□□□□ -0.59
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CS-204ENST00000546621 UACAQ9BZF9 1416 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 MAPKBP1O60336 1514 aa11.32□□□□□ -0.6
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CS-204ENST00000546621 NAIPQ13075 1403 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 AKNAQ7Z591 1439 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 ABCC2Q92887 1545 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 DAPK1P53355 1430 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-204ENST00000546621 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 ABCC5O15440 1437 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 ROCK1Q13464 1354 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
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CS-204ENST00000546621 PREX2Q70Z35 1606 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-204ENST00000546621 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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CS-204ENST00000546621 ADGRL2O95490 1459 aa11.2□□□□□ -0.62
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CS-204ENST00000546621 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 NCOA1Q15788 1441 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 ABCB7O75027 752 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 TRIM52Q96A61 297 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-204ENST00000546621 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.15□□□□□ -0.63
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CS-204ENST00000546621 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.14□□□□□ -0.63
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CS-204ENST00000546621 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.14□□□□□ -0.63
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CS-204ENST00000546621 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 KCNH8Q96L42 1107 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 TSPY4P0CV99 314 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 TSPY10P0CW01 314 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 PLCH2O75038 1416 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 TONSLQ96HA7 1378 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-204ENST00000546621 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.09□□□□□ -0.63
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