RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546298.5

YBX3-218, Transcript of Y-box binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene YBX3, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX3-218ENST00000546298 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.02□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.02□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.01□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.01□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 PTPRMP28827 1452 aa15.01□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 ATP10AO60312 1499 aa14.99□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.99□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 MLECQ14165 292 aa14.98□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 RICTORQ6R327 1708 aa14.97□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.96□□□□□ -0.01
YBX3-218ENST00000546298 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.96□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 CEP162Q5TB80 1403 aa14.95□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.95□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.95□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.94□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 POTEDQ86YR6 584 aa14.94□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.94□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.93□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.92□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.91□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.91□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.9□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
YBX3-218ENST00000546298 MADDQ8WXG6 1647 aa14.89□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 27.2
YBX3-218ENST00000546298 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 KDM5CP41229 1560 aa14.89□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.89□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.88□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.88□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.88□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 PREX2Q70Z35 1606 aa14.87□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 ABCC1P33527 1531 aa14.87□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.84□□□□□ -0.03
YBX3-218ENST00000546298 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 AGLP35573 1532 aa14.82□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.82□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 REREQ9P2R6 1566 aa14.81□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.81□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 HSPA2P54652 639 aa14.81□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.81□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.81□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.8□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.8□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.79□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.78□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.78□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.78□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.77□□□□□ -0.04
YBX3-218ENST00000546298 APLP2Q06481 763 aa14.76□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.76□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 ABCA6Q8N139 1617 aa14.76□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 NCOA2Q15596 1464 aa14.76□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 A2MP01023 1474 aa14.74□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 MBD5Q9P267 1494 aa14.74□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.74□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 TIAM1Q13009 1591 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 ATP7AQ04656 1500 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 TSPY4P0CV99 314 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 TSPY10P0CW01 314 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 GGT6Q6P531 493 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.73□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.71□□□□□ -0.05
YBX3-218ENST00000546298 ZMYM3Q14202 1370 aa14.71□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 FBXO41Q8TF61 875 aa14.7□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 MAP3K1Q13233 1512 aa14.7□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.69□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 KIF3BO15066 747 aa14.67□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.67□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 NPATQ14207 1427 aa14.66□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 MIA2Q96PC5 1412 aa14.65□□□□□ -0.06
YBX3-218ENST00000546298 PLXNC1O60486 1568 aa14.64□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.63□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 CERKQ8TCT0 537 aa14.62□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.61□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.61□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.6□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 PTPRKQ15262 1439 aa14.59□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 C3P01024 1663 aa14.58□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.58□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 PTPRTO14522 1441 aa14.58□□□□□ -0.07
YBX3-218ENST00000546298 MROH2AA6NES4 1674 aa14.56□□□□□ -0.08
YBX3-218ENST00000546298 PKD2Q13563 968 aa14.56□□□□□ -0.08
YBX3-218ENST00000546298 NCOA1Q15788 1441 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms