RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 PLCH2O75038 1416 aa40.71■■■■■ 4.11
MACROD1-208ENST00000545464 HECW1Q76N89 1606 aa40.7■■■■■ 4.11
MACROD1-208ENST00000545464 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.7■■■■■ 4.11
MACROD1-208ENST00000545464 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.67■■■■■ 4.1
MACROD1-208ENST00000545464 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.63■■■■■ 4.09
MACROD1-208ENST00000545464 FMN1Q68DA7 1419 aa40.62■■■■■ 4.09
MACROD1-208ENST00000545464 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
MACROD1-208ENST00000545464 ATP10AO60312 1499 aa40.54■■■■■ 4.08
MACROD1-208ENST00000545464 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.53■■■■■ 4.08
MACROD1-208ENST00000545464 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.53■■■■■ 4.08
MACROD1-208ENST00000545464 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.52■■■■■ 4.08
MACROD1-208ENST00000545464 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.51■■■■■ 4.08
MACROD1-208ENST00000545464 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.5■■■■■ 4.07
MACROD1-208ENST00000545464 KIF14Q15058 1648 aa40.48■■■■■ 4.07
MACROD1-208ENST00000545464 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
MACROD1-208ENST00000545464 AFAP1Q8N556 730 aa40.45■■■■■ 4.07
MACROD1-208ENST00000545464 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.44■■■■■ 4.06
MACROD1-208ENST00000545464 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
MACROD1-208ENST00000545464 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.42■■■■■ 4.06
MACROD1-208ENST00000545464 CLIP1P30622 1438 aa40.41■■■■■ 4.06
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.39■■■■■ 4.06
MACROD1-208ENST00000545464 CERKQ8TCT0 537 aa40.38■■■■■ 4.05
MACROD1-208ENST00000545464 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.33■■■■■ 4.05
MACROD1-208ENST00000545464 KDM5CP41229 1560 aa40.27■■■■■ 4.04
MACROD1-208ENST00000545464 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.26■■■■■ 4.04
MACROD1-208ENST00000545464 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.25■■■■■ 4.03
MACROD1-208ENST00000545464 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.21■■■■■ 4.03
MACROD1-208ENST00000545464 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
MACROD1-208ENST00000545464 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.19■■■■■ 4.02
MACROD1-208ENST00000545464 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.18■■■■■ 4.02
MACROD1-208ENST00000545464 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.16■■■■■ 4.02
MACROD1-208ENST00000545464 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.16■■■■■ 4.02
MACROD1-208ENST00000545464 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.14■■■■■ 4.02
MACROD1-208ENST00000545464 ABCA6Q8N139 1617 aa40.13■■■■■ 4.02
MACROD1-208ENST00000545464 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.12■■■■■ 4.01
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.11■■■■■ 4.01
MACROD1-208ENST00000545464 PREX2Q70Z35 1606 aa40.1■■■■■ 4.01
MACROD1-208ENST00000545464 ABCC1P33527 1531 aa40.09■■■■■ 4.01
MACROD1-208ENST00000545464 REREQ9P2R6 1566 aa40.09■■■■■ 4.01
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
MACROD1-208ENST00000545464 STRCQ7RTU9 1775 aa40.05■■■■■ 4
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MACROD1-208ENST00000545464 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.95■■■■□ 3.99
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MACROD1-208ENST00000545464 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.91■■■■□ 3.98
MACROD1-208ENST00000545464 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.982e-7■■■■■ 30.1
MACROD1-208ENST00000545464 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.89■■■■□ 3.98
MACROD1-208ENST00000545464 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
MACROD1-208ENST00000545464 PTPRTO14522 1441 aa39.88■■■■□ 3.97
MACROD1-208ENST00000545464 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.87■■■■□ 3.97
MACROD1-208ENST00000545464 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.85■■■■□ 3.97
MACROD1-208ENST00000545464 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
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MACROD1-208ENST00000545464 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.79■■■■□ 3.96
MACROD1-208ENST00000545464 ZMYM3Q14202 1370 aa39.77■■■■□ 3.96
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MACROD1-208ENST00000545464 NPATQ14207 1427 aa39.71■■■■□ 3.95
MACROD1-208ENST00000545464 ATP7AQ04656 1500 aa39.7■■■■□ 3.95
MACROD1-208ENST00000545464 GGT6Q6P531 493 aa39.69■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.69■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.68■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.68■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.68■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 MROH2AA6NES4 1674 aa39.67■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.66■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.66■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 A2MP01023 1474 aa39.66■■■■□ 3.94
MACROD1-208ENST00000545464 ILDR2Q71H61 639 aa39.64■■■■□ 3.94
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MACROD1-208ENST00000545464 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
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MACROD1-208ENST00000545464 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
MACROD1-208ENST00000545464 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.52■■■■□ 3.92
MACROD1-208ENST00000545464 PTPRKQ15262 1439 aa39.52■■■■□ 3.92
MACROD1-208ENST00000545464 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.5■■■■□ 3.91
MACROD1-208ENST00000545464 PKD2Q13563 968 aa39.49■■■■□ 3.91
MACROD1-208ENST00000545464 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.46■■■■□ 3.91
MACROD1-208ENST00000545464 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
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MACROD1-208ENST00000545464 TIAM1Q13009 1591 aa39.44■■■■□ 3.9
MACROD1-208ENST00000545464 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.44■■■■□ 3.9
MACROD1-208ENST00000545464 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.44■■■■□ 3.9
MACROD1-208ENST00000545464 SOCS7O14512 581 aa39.43■■■■□ 3.9
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
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MACROD1-208ENST00000545464 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
MACROD1-208ENST00000545464 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
MACROD1-208ENST00000545464 KIF3BO15066 747 aa39.35■■■■□ 3.89
MACROD1-208ENST00000545464 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.34■■■■□ 3.89
MACROD1-208ENST00000545464 CEP162Q5TB80 1403 aa39.32■■■■□ 3.89
MACROD1-208ENST00000545464 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
MACROD1-208ENST00000545464 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.3■■■■□ 3.88
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