RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 WDR62O43379 1518 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 MRS2Q9HD23 443 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 IQGAP2Q13576 1575 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 CCDC184Q52MB2 194 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 PBRM1Q86U86 1689 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 DAPK1P53355 1430 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 MBD5Q9P267 1494 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 KIF14Q15058 1648 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.33□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
CS-202ENST00000542324 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 ADAMTS12P58397 1594 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 NUDCQ9Y266 331 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 ABCC5O15440 1437 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 KDM5CP41229 1560 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 PZPP20742 1482 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.27□□□□□ -0.12
CS-202ENST00000542324 ADGRL2O95490 1459 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 KIAA0556O60303 1618 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 USP47Q96K76 1375 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 E9PCH4 1651 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-202ENST00000542324 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
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CS-202ENST00000542324 FOXD1Q16676 465 aa14.21□□□□□ -0.14
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CS-202ENST00000542324 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 KIF15Q9NS87 1388 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 DISP1Q96F81 1524 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-202ENST00000542324 INSRP06213 1382 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 RALBP1Q15311 655 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 CEP170Q5SW79 1584 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 PDE3BQ13370 1112 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 TMC1Q8TDI8 760 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 MS4A1P11836 297 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 NBR1Q14596 966 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 USP35Q9P2H5 1018 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 LAMC1P11047 1609 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.08□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.08□□□□□ -0.15
CS-202ENST00000542324 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 IFT140Q96RY7 1462 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 PTPRGP23470 1445 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 ERCC6Q03468 1493 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 PKD2Q13563 968 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-202ENST00000542324 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.04□□□□□ -0.16
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