RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRL1O94910 1474 aa25.85■■□□□ 1.73
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TIAM1Q13009 1591 aa25.83■■□□□ 1.73
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.81■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.8■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.8■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.79■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.79■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAPGEF3O95398 923 aa25.78■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCC1P33527 1531 aa25.78■■□□□ 1.72
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.75■■□□□ 1.71
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.72■■□□□ 1.71
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.72■■□□□ 1.71
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.71■■□□□ 1.71
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.66■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.64■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.64■■□□□ 1.7
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.63■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.62■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.62■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.61■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.61■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.59■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.59■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-221ENST00000540665 REREQ9P2R6 1566 aa25.57■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.57■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.57■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.57■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCA6Q8N139 1617 aa25.57■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.54■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP10AO60312 1499 aa25.54■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AFAP1Q8N556 730 aa25.52■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MADDQ8WXG6 1647 aa25.5■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP7AQ04656 1500 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MBD5Q9P267 1494 aa25.46■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APLP2Q06481 763 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.44■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AGLP35573 1532 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 MIA2Q96PC5 1412 aa25.41■■□□□ 1.66
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.37■■□□□ 1.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.33■■□□□ 1.65
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A2MP01023 1474 aa25.29■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.26■■□□□ 1.63
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 MROH2AA6NES4 1674 aa25.24■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MLECQ14165 292 aa25.23■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.21■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C3P01024 1663 aa25.2■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.17■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSPY4P0CV99 314 aa25.16■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSPY10P0CW01 314 aa25.16■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCC5O15440 1437 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DAPK1P53355 1430 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.05■■□□□ 1.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.04■■□□□ 1.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRL2O95490 1459 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERBINQ96RT1 1412 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MROH1Q8NDA8 1641 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NPATQ14207 1427 aa24.99■■□□□ 1.59
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