RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536283.1

ARF3-205, Transcript of ADP ribosylation factor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ARF3, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3-205ENST00000536283 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.94■■■■□ 3.34
ARF3-205ENST00000536283 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.93■■■■□ 3.34
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ARF3-205ENST00000536283 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.93■■■■□ 3.34
ARF3-205ENST00000536283 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.92■■■■□ 3.34
ARF3-205ENST00000536283 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.88■■■■□ 3.33
ARF3-205ENST00000536283 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.88■■■■□ 3.33
ARF3-205ENST00000536283 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.87■■■■□ 3.33
ARF3-205ENST00000536283 PREX2Q70Z35 1606 aa35.83■■■■□ 3.33
ARF3-205ENST00000536283 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.83■■■■□ 3.33
ARF3-205ENST00000536283 MADDQ8WXG6 1647 aa35.83■■■■□ 3.33
ARF3-205ENST00000536283 PTPRMP28827 1452 aa35.81■■■■□ 3.32
ARF3-205ENST00000536283 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.78■■■■□ 3.32
ARF3-205ENST00000536283 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.77■■■■□ 3.32
ARF3-205ENST00000536283 CEP162Q5TB80 1403 aa35.74■■■■□ 3.31
ARF3-205ENST00000536283 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.74■■■■□ 3.31
ARF3-205ENST00000536283 KDM5CP41229 1560 aa35.72■■■■□ 3.31
ARF3-205ENST00000536283 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
ARF3-205ENST00000536283 ABCC1P33527 1531 aa35.7■■■■□ 3.31
ARF3-205ENST00000536283 ATP10AO60312 1499 aa35.69■■■■□ 3.3
ARF3-205ENST00000536283 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.67■■■■□ 3.3
ARF3-205ENST00000536283 AFAP1Q8N556 730 aa35.67■■■■□ 3.3
ARF3-205ENST00000536283 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.66■■■■□ 3.3
ARF3-205ENST00000536283 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.62■■■■□ 3.29
ARF3-205ENST00000536283 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.62■■■■□ 3.29
ARF3-205ENST00000536283 MLECQ14165 292 aa35.61■■■■□ 3.29
ARF3-205ENST00000536283 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.6■■■■□ 3.29
ARF3-205ENST00000536283 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.6■■■■□ 3.29
ARF3-205ENST00000536283 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
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ARF3-205ENST00000536283 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.59■■■■□ 3.29
ARF3-205ENST00000536283 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.57■■■■□ 3.28
ARF3-205ENST00000536283 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.56■■■■□ 3.28
ARF3-205ENST00000536283 ABCA6Q8N139 1617 aa35.55■■■■□ 3.28
ARF3-205ENST00000536283 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
ARF3-205ENST00000536283 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.53■■■■□ 3.28
ARF3-205ENST00000536283 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.52■■■■□ 3.28
ARF3-205ENST00000536283 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.51■■■■□ 3.27
ARF3-205ENST00000536283 REREQ9P2R6 1566 aa35.5■■■■□ 3.27
ARF3-205ENST00000536283 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.49■■■■□ 3.27
ARF3-205ENST00000536283 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.48■■■■□ 3.27
ARF3-205ENST00000536283 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.46■■■■□ 3.27
ARF3-205ENST00000536283 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
ARF3-205ENST00000536283 TIAM1Q13009 1591 aa35.44■■■■□ 3.26
ARF3-205ENST00000536283 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.44■■■■□ 3.26
ARF3-205ENST00000536283 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.42■■■■□ 3.26
ARF3-205ENST00000536283 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.26
ARF3-205ENST00000536283 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.39■■■■□ 3.26
ARF3-205ENST00000536283 AGLP35573 1532 aa35.37■■■■□ 3.25
ARF3-205ENST00000536283 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.35■■■■□ 3.25
ARF3-205ENST00000536283 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
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ARF3-205ENST00000536283 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
ARF3-205ENST00000536283 NCOA2Q15596 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
ARF3-205ENST00000536283 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
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ARF3-205ENST00000536283 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.22■■■■□ 3.23
ARF3-205ENST00000536283 HSPA2P54652 639 aa35.22■■■■□ 3.23
ARF3-205ENST00000536283 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
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ARF3-205ENST00000536283 C3P01024 1663 aa35.18■■■■□ 3.22
ARF3-205ENST00000536283 PLXNC1O60486 1568 aa35.18■■■■□ 3.22
ARF3-205ENST00000536283 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.18■■■■□ 3.22
ARF3-205ENST00000536283 A2MP01023 1474 aa35.17■■■■□ 3.22
ARF3-205ENST00000536283 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.16■■■■□ 3.22
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ARF3-205ENST00000536283 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.14■■■■□ 3.22
ARF3-205ENST00000536283 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.14■■■■□ 3.22
ARF3-205ENST00000536283 MAP3K1Q13233 1512 aa35.11■■■■□ 3.21
ARF3-205ENST00000536283 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.09■■■■□ 3.21
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ARF3-205ENST00000536283 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.07■■■■□ 3.21
ARF3-205ENST00000536283 MROH2AA6NES4 1674 aa35.06■■■■□ 3.2
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ARF3-205ENST00000536283 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.99■■■■□ 3.19
ARF3-205ENST00000536283 GGT6Q6P531 493 aa34.98■■■■□ 3.19
ARF3-205ENST00000536283 ZMYM3Q14202 1370 aa34.96■■■■□ 3.19
ARF3-205ENST00000536283 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
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ARF3-205ENST00000536283 APLP2Q06481 763 aa34.9■■■■□ 3.18
ARF3-205ENST00000536283 MIA2Q96PC5 1412 aa34.89■■■■□ 3.18
ARF3-205ENST00000536283 STRCQ7RTU9 1775 aa34.88■■■■□ 3.17
ARF3-205ENST00000536283 TSPY4P0CV99 314 aa34.88■■■■□ 3.17
ARF3-205ENST00000536283 TSPY10P0CW01 314 aa34.88■■■■□ 3.17
ARF3-205ENST00000536283 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.86■■■■□ 3.17
ARF3-205ENST00000536283 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.83■■■■□ 3.17
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ARF3-205ENST00000536283 FBXO41Q8TF61 875 aa34.81■■■■□ 3.16
ARF3-205ENST00000536283 PTPRKQ15262 1439 aa34.81■■■■□ 3.16
ARF3-205ENST00000536283 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.79■■■■□ 3.16
ARF3-205ENST00000536283 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.77■■■■□ 3.16
ARF3-205ENST00000536283 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.76■■■■□ 3.16
ARF3-205ENST00000536283 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.76■■■■□ 3.15
ARF3-205ENST00000536283 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ARF3-205ENST00000536283 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.73■■■■□ 3.15
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