RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
PUF60-218ENST00000531995 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PUF60-218ENST00000531995 PLCH2O75038 1416 aa30.1■■■□□ 2.41
PUF60-218ENST00000531995 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.1■■■□□ 2.41
PUF60-218ENST00000531995 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.05■■■□□ 2.4
PUF60-218ENST00000531995 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PUF60-218ENST00000531995 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.03■■■□□ 2.4
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.02■■■□□ 2.4
PUF60-218ENST00000531995 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.01■■■□□ 2.4
PUF60-218ENST00000531995 CLIP1P30622 1438 aa29.99■■■□□ 2.39
PUF60-218ENST00000531995 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.98■■■□□ 2.39
PUF60-218ENST00000531995 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PUF60-218ENST00000531995 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.96■■■□□ 2.39
PUF60-218ENST00000531995 PREX2Q70Z35 1606 aa29.96■■■□□ 2.39
PUF60-218ENST00000531995 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.93■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 CEP162Q5TB80 1403 aa29.93■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.93■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 KDM5CP41229 1560 aa29.92■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.91■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.91■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.91■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.9■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 MLECQ14165 292 aa29.9■■■□□ 2.38
PUF60-218ENST00000531995 ATP10AO60312 1499 aa29.87■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.87■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.87■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.86■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 ABCC1P33527 1531 aa29.86■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.86■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.86■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 ABCA6Q8N139 1617 aa29.85■■■□□ 2.37
PUF60-218ENST00000531995 AFAP1Q8N556 730 aa29.77■■■□□ 2.36
PUF60-218ENST00000531995 HSPA2P54652 639 aa29.75■■■□□ 2.35
PUF60-218ENST00000531995 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.75■■■□□ 2.35
PUF60-218ENST00000531995 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.74■■■□□ 2.35
PUF60-218ENST00000531995 REREQ9P2R6 1566 aa29.73■■■□□ 2.35
PUF60-218ENST00000531995 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.73■■■□□ 2.35
PUF60-218ENST00000531995 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.71■■■□□ 2.35
PUF60-218ENST00000531995 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.7■■■□□ 2.35
PUF60-218ENST00000531995 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.69■■■□□ 2.34
PUF60-218ENST00000531995 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.67■■■□□ 2.34
PUF60-218ENST00000531995 C3P01024 1663 aa29.63■■■□□ 2.33
PUF60-218ENST00000531995 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PUF60-218ENST00000531995 AGLP35573 1532 aa29.6■■■□□ 2.33
PUF60-218ENST00000531995 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
PUF60-218ENST00000531995 FBXO41Q8TF61 875 aa29.59■■■□□ 2.33
PUF60-218ENST00000531995 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PUF60-218ENST00000531995 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.54■■■□□ 2.32
PUF60-218ENST00000531995 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PUF60-218ENST00000531995 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PUF60-218ENST00000531995 ATP7AQ04656 1500 aa29.52■■■□□ 2.32
PUF60-218ENST00000531995 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.52■■■□□ 2.32
PUF60-218ENST00000531995 TIAM1Q13009 1591 aa29.52■■■□□ 2.32
PUF60-218ENST00000531995 STRCQ7RTU9 1775 aa29.51■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.51■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.5■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.49■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 PLXNC1O60486 1568 aa29.45■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.45■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
PUF60-218ENST00000531995 MROH2AA6NES4 1674 aa29.44■■■□□ 2.3
PUF60-218ENST00000531995 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PUF60-218ENST00000531995 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PUF60-218ENST00000531995 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PUF60-218ENST00000531995 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.41■■■□□ 2.3
PUF60-218ENST00000531995 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.4■■■□□ 2.3
PUF60-218ENST00000531995 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.38■■■□□ 2.29
PUF60-218ENST00000531995 A2MP01023 1474 aa29.36■■■□□ 2.29
PUF60-218ENST00000531995 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
PUF60-218ENST00000531995 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.31■■■□□ 2.28
PUF60-218ENST00000531995 CERKQ8TCT0 537 aa29.31■■■□□ 2.28
PUF60-218ENST00000531995 MBD5Q9P267 1494 aa29.29■■■□□ 2.28
PUF60-218ENST00000531995 NCOA2Q15596 1464 aa29.27■■■□□ 2.28
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K1Q13233 1512 aa29.26■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 NPATQ14207 1427 aa29.26■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.25■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.24■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 NCOA1Q15788 1441 aa29.24■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 ZMYM3Q14202 1370 aa29.24■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.21■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.21■■■□□ 2.27
PUF60-218ENST00000531995 PTPRTO14522 1441 aa29.2■■■□□ 2.26
PUF60-218ENST00000531995 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PUF60-218ENST00000531995 GGT6Q6P531 493 aa29.19■■■□□ 2.26
PUF60-218ENST00000531995 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.17■■■□□ 2.26
PUF60-218ENST00000531995 PTPRKQ15262 1439 aa29.16■■■□□ 2.26
PUF60-218ENST00000531995 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.15■■■□□ 2.26
PUF60-218ENST00000531995 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.12■■■□□ 2.25
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.11■■■□□ 2.25
PUF60-218ENST00000531995 APLP2Q06481 763 aa29.09■■■□□ 2.25
PUF60-218ENST00000531995 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PUF60-218ENST00000531995 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.08■■■□□ 2.25
PUF60-218ENST00000531995 PLA2R1Q13018 1463 aa29.04■■■□□ 2.24
PUF60-218ENST00000531995 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.02■■■□□ 2.24
PUF60-218ENST00000531995 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PUF60-218ENST00000531995 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.01■■■□□ 2.23
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