RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531938.1

AP000911.1-206, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP000911.1, Length 711 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000911.1-206ENST00000531938 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.81■■■■■ 4.44
AP000911.1-206ENST00000531938 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.77■■■■■ 4.44
AP000911.1-206ENST00000531938 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.77■■■■■ 4.44
AP000911.1-206ENST00000531938 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.77■■■■■ 4.44
AP000911.1-206ENST00000531938 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.77■■■■■ 4.44
AP000911.1-206ENST00000531938 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.74■■■■■ 4.43
AP000911.1-206ENST00000531938 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.71■■■■■ 4.43
AP000911.1-206ENST00000531938 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.71■■■■■ 4.43
AP000911.1-206ENST00000531938 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.67■■■■■ 4.42
AP000911.1-206ENST00000531938 PREX2Q70Z35 1606 aa42.64■■■■■ 4.42
AP000911.1-206ENST00000531938 PTPRMP28827 1452 aa42.64■■■■■ 4.42
AP000911.1-206ENST00000531938 MADDQ8WXG6 1647 aa42.64■■■■■ 4.42
AP000911.1-206ENST00000531938 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.63■■■■■ 4.41
AP000911.1-206ENST00000531938 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.61■■■■■ 4.41
AP000911.1-206ENST00000531938 CEP162Q5TB80 1403 aa42.59■■■■■ 4.41
AP000911.1-206ENST00000531938 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.59■■■■■ 4.41
AP000911.1-206ENST00000531938 AFAP1Q8N556 730 aa42.57■■■■■ 4.41
AP000911.1-206ENST00000531938 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
AP000911.1-206ENST00000531938 ATP10AO60312 1499 aa42.54■■■■■ 4.4
AP000911.1-206ENST00000531938 MLECQ14165 292 aa42.53■■■■■ 4.4
AP000911.1-206ENST00000531938 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.52■■■■■ 4.4
AP000911.1-206ENST00000531938 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.49■■■■■ 4.39
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM5CP41229 1560 aa42.48■■■■■ 4.39
AP000911.1-206ENST00000531938 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.48■■■■■ 4.39
AP000911.1-206ENST00000531938 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCC1P33527 1531 aa42.46■■■■■ 4.39
AP000911.1-206ENST00000531938 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.46■■■■■ 4.39
AP000911.1-206ENST00000531938 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.42■■■■■ 4.38
AP000911.1-206ENST00000531938 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.41■■■■■ 4.38
AP000911.1-206ENST00000531938 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.41■■■■■ 4.38
AP000911.1-206ENST00000531938 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.4■■■■■ 4.38
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.4■■■■■ 4.38
AP000911.1-206ENST00000531938 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
AP000911.1-206ENST00000531938 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.39■■■■■ 4.38
AP000911.1-206ENST00000531938 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.36■■■■■ 4.37
AP000911.1-206ENST00000531938 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
AP000911.1-206ENST00000531938 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.33■■■■■ 4.37
AP000911.1-206ENST00000531938 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.32■■■■■ 4.37
AP000911.1-206ENST00000531938 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.3■■■■■ 4.36
AP000911.1-206ENST00000531938 ABCA6Q8N139 1617 aa42.29■■■■■ 4.36
AP000911.1-206ENST00000531938 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.26■■■■■ 4.36
AP000911.1-206ENST00000531938 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
AP000911.1-206ENST00000531938 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.24■■■■■ 4.35
AP000911.1-206ENST00000531938 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.23■■■■■ 4.35
AP000911.1-206ENST00000531938 REREQ9P2R6 1566 aa42.22■■■■■ 4.35
AP000911.1-206ENST00000531938 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
AP000911.1-206ENST00000531938 TIAM1Q13009 1591 aa42.18■■■■■ 4.34
AP000911.1-206ENST00000531938 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.17■■■■■ 4.34
AP000911.1-206ENST00000531938 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.14■■■■■ 4.34
AP000911.1-206ENST00000531938 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.12■■■■■ 4.33
AP000911.1-206ENST00000531938 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
AP000911.1-206ENST00000531938 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
AP000911.1-206ENST00000531938 AGLP35573 1532 aa42.1■■■■■ 4.33
AP000911.1-206ENST00000531938 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
AP000911.1-206ENST00000531938 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
AP000911.1-206ENST00000531938 ATP7AQ04656 1500 aa42.05■■■■■ 4.32
AP000911.1-206ENST00000531938 NCOA2Q15596 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
AP000911.1-206ENST00000531938 HSPA2P54652 639 aa42.01■■■■■ 4.32
AP000911.1-206ENST00000531938 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
AP000911.1-206ENST00000531938 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
AP000911.1-206ENST00000531938 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.95■■■■■ 4.31
AP000911.1-206ENST00000531938 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.92■■■■■ 4.3
AP000911.1-206ENST00000531938 C3P01024 1663 aa41.91■■■■■ 4.3
AP000911.1-206ENST00000531938 A2MP01023 1474 aa41.91■■■■■ 4.3
AP000911.1-206ENST00000531938 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
AP000911.1-206ENST00000531938 MBD5Q9P267 1494 aa41.9■■■■■ 4.3
AP000911.1-206ENST00000531938 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.88■■■■■ 4.29
AP000911.1-206ENST00000531938 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.87■■■■■ 4.29
AP000911.1-206ENST00000531938 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.86■■■■■ 4.29
AP000911.1-206ENST00000531938 MAP3K1Q13233 1512 aa41.83■■■■■ 4.29
AP000911.1-206ENST00000531938 PLXNC1O60486 1568 aa41.81■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.81■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.81■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.8■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.8■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 APLP2Q06481 763 aa41.8■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 GGT6Q6P531 493 aa41.79■■■■■ 4.28
AP000911.1-206ENST00000531938 MROH2AA6NES4 1674 aa41.75■■■■■ 4.27
AP000911.1-206ENST00000531938 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
AP000911.1-206ENST00000531938 TSPY4P0CV99 314 aa41.71■■■■■ 4.27
AP000911.1-206ENST00000531938 TSPY10P0CW01 314 aa41.71■■■■■ 4.27
AP000911.1-206ENST00000531938 ZMYM3Q14202 1370 aa41.7■■■■■ 4.27
AP000911.1-206ENST00000531938 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.68■■■■■ 4.26
AP000911.1-206ENST00000531938 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
AP000911.1-206ENST00000531938 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.63■■■■■ 4.25
AP000911.1-206ENST00000531938 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.61■■■■■ 4.25
AP000911.1-206ENST00000531938 KIF3BO15066 747 aa41.59■■■■■ 4.25
AP000911.1-206ENST00000531938 NPATQ14207 1427 aa41.59■■■■■ 4.25
AP000911.1-206ENST00000531938 MIA2Q96PC5 1412 aa41.58■■■■■ 4.25
AP000911.1-206ENST00000531938 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.56■■■■■ 4.24
AP000911.1-206ENST00000531938 STRCQ7RTU9 1775 aa41.55■■■■■ 4.24
AP000911.1-206ENST00000531938 FBXO41Q8TF61 875 aa41.52■■■■■ 4.24
AP000911.1-206ENST00000531938 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.46■■■■■ 4.23
AP000911.1-206ENST00000531938 PTPRKQ15262 1439 aa41.44■■■■■ 4.23
AP000911.1-206ENST00000531938 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.41■■■■■ 4.22
AP000911.1-206ENST00000531938 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.39■■■■■ 4.22
AP000911.1-206ENST00000531938 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.38■■■■■ 4.21
AP000911.1-206ENST00000531938 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.38■■■■■ 4.21
AP000911.1-206ENST00000531938 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.35■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms