RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527744.5

PUF60-211, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-211ENST00000527744 ILDR2Q71H61 639 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-211ENST00000527744 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 STRCQ7RTU9 1775 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 ATP10AO60312 1499 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 SOCS7O14512 581 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 PLCH2O75038 1416 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-211ENST00000527744 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUF60-211ENST00000527744 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PUF60-211ENST00000527744 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.82■■□□□ 1.08
PUF60-211ENST00000527744 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.77■■□□□ 1.08
PUF60-211ENST00000527744 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.75■■□□□ 1.07
PUF60-211ENST00000527744 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.75■■□□□ 1.07
PUF60-211ENST00000527744 EEA1Q15075 1411 aa21.74■■□□□ 1.07
PUF60-211ENST00000527744 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.73■■□□□ 1.07
PUF60-211ENST00000527744 PTPRTO14522 1441 aa21.72■■□□□ 1.07
PUF60-211ENST00000527744 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.72■■□□□ 1.07
PUF60-211ENST00000527744 KDM5CP41229 1560 aa21.71■■□□□ 1.07
PUF60-211ENST00000527744 C3P01024 1663 aa21.69■■□□□ 1.06
PUF60-211ENST00000527744 AFAP1Q8N556 730 aa21.68■■□□□ 1.06
PUF60-211ENST00000527744 REREQ9P2R6 1566 aa21.68■■□□□ 1.06
PUF60-211ENST00000527744 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.68■■□□□ 1.06
PUF60-211ENST00000527744 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.68■■□□□ 1.06
PUF60-211ENST00000527744 KIF14Q15058 1648 aa21.67■■□□□ 1.06
PUF60-211ENST00000527744 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.64■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 ABCA6Q8N139 1617 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.63■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 FMN1Q68DA7 1419 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 AGLP35573 1532 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.59■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 NCOA1Q15788 1441 aa21.58■■□□□ 1.05
PUF60-211ENST00000527744 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.55■■□□□ 1.04
PUF60-211ENST00000527744 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-211ENST00000527744 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PUF60-211ENST00000527744 CLIP1P30622 1438 aa21.54■■□□□ 1.04
PUF60-211ENST00000527744 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.53■■□□□ 1.04
PUF60-211ENST00000527744 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.52■■□□□ 1.04
PUF60-211ENST00000527744 ABCC1P33527 1531 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-211ENST00000527744 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-211ENST00000527744 PREX2Q70Z35 1606 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-211ENST00000527744 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.5■■□□□ 1.03
PUF60-211ENST00000527744 MROH2AA6NES4 1674 aa21.49■■□□□ 1.03
PUF60-211ENST00000527744 NPATQ14207 1427 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-211ENST00000527744 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.43■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.42■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 ZMYM3Q14202 1370 aa21.42■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.42■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.4■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PUF60-211ENST00000527744 PLA2R1Q13018 1463 aa21.39■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.37■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 PKD2Q13563 968 aa21.36■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.34■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 PTPRKQ15262 1439 aa21.33■■□□□ 1.01
PUF60-211ENST00000527744 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.32■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 PLXNC1O60486 1568 aa21.31■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.31■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 ATP7AQ04656 1500 aa21.29■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.28■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 A2MP01023 1474 aa21.27■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 17e-7■■■□□ 18.4
PUF60-211ENST00000527744 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PUF60-211ENST00000527744 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PUF60-211ENST00000527744 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.24■□□□□ 0.99
PUF60-211ENST00000527744 HSPA1LP34931 641 aa21.24■□□□□ 0.99
PUF60-211ENST00000527744 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PUF60-211ENST00000527744 GGT6Q6P531 493 aa21.23■□□□□ 0.99
PUF60-211ENST00000527744 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.22■□□□□ 0.99
PUF60-211ENST00000527744 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.2■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.2■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.2■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 CPS1P31327 1500 aa21.19■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 TOM1O60784 492 aa21.18■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 PIP4K2BP78356 416 aa21.18■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.18■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PUF60-211ENST00000527744 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-211ENST00000527744 ALKQ9UM73 1620 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms