RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514318.1

RACK1-232, Transcript of receptor for activated C kinase 1, humanhuman

TSL 3

Gene RACK1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1-232ENST00000514318 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.82■■□□□ 1.88
RACK1-232ENST00000514318 KIF14Q15058 1648 aa26.82■■□□□ 1.88
RACK1-232ENST00000514318 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.8■■□□□ 1.88
RACK1-232ENST00000514318 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.8■■□□□ 1.88
RACK1-232ENST00000514318 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.78■■□□□ 1.88
RACK1-232ENST00000514318 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.77■■□□□ 1.88
RACK1-232ENST00000514318 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
RACK1-232ENST00000514318 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RACK1-232ENST00000514318 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RACK1-232ENST00000514318 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.71■■□□□ 1.87
RACK1-232ENST00000514318 ATP10AO60312 1499 aa26.7■■□□□ 1.87
RACK1-232ENST00000514318 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.69■■□□□ 1.86
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RACK1-232ENST00000514318 CLIP1P30622 1438 aa26.68■■□□□ 1.86
RACK1-232ENST00000514318 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.68■■□□□ 1.86
RACK1-232ENST00000514318 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.68■■□□□ 1.86
RACK1-232ENST00000514318 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.68■■□□□ 1.86
RACK1-232ENST00000514318 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.68■■□□□ 1.86
RACK1-232ENST00000514318 FBXO41Q8TF61 875 aa26.67■■□□□ 1.86
RACK1-232ENST00000514318 MLECQ14165 292 aa26.63■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 PREX2Q70Z35 1606 aa26.63■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.6■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.6■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.59■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 HSPA2P54652 639 aa26.59■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.59■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 REREQ9P2R6 1566 aa26.58■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.58■■□□□ 1.85
RACK1-232ENST00000514318 ABCA6Q8N139 1617 aa26.57■■□□□ 1.84
RACK1-232ENST00000514318 ABCC1P33527 1531 aa26.56■■□□□ 1.84
RACK1-232ENST00000514318 AFAP1Q8N556 730 aa26.56■■□□□ 1.84
RACK1-232ENST00000514318 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.56■■□□□ 1.84
RACK1-232ENST00000514318 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.54■■□□□ 1.84
RACK1-232ENST00000514318 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.53■■□□□ 1.84
RACK1-232ENST00000514318 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.51■■□□□ 1.83
RACK1-232ENST00000514318 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.48■■□□□ 1.83
RACK1-232ENST00000514318 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.46■■□□□ 1.83
RACK1-232ENST00000514318 AGLP35573 1532 aa26.46■■□□□ 1.83
RACK1-232ENST00000514318 C3P01024 1663 aa26.44■■□□□ 1.82
RACK1-232ENST00000514318 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
RACK1-232ENST00000514318 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.43■■□□□ 1.82
RACK1-232ENST00000514318 STRCQ7RTU9 1775 aa26.42■■□□□ 1.82
RACK1-232ENST00000514318 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RACK1-232ENST00000514318 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.41■■□□□ 1.82
RACK1-232ENST00000514318 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.37■■□□□ 1.81
RACK1-232ENST00000514318 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.35■■□□□ 1.81
RACK1-232ENST00000514318 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
RACK1-232ENST00000514318 CERKQ8TCT0 537 aa26.33■■□□□ 1.81
RACK1-232ENST00000514318 MROH2AA6NES4 1674 aa26.31■■□□□ 1.8
RACK1-232ENST00000514318 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.29■■□□□ 1.8
RACK1-232ENST00000514318 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RACK1-232ENST00000514318 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
RACK1-232ENST00000514318 ATP7AQ04656 1500 aa26.26■■□□□ 1.79
RACK1-232ENST00000514318 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RACK1-232ENST00000514318 PLXNC1O60486 1568 aa26.25■■□□□ 1.79
RACK1-232ENST00000514318 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.25■■□□□ 1.79
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RACK1-232ENST00000514318 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.24■■□□□ 1.79
RACK1-232ENST00000514318 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
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RACK1-232ENST00000514318 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.2■■□□□ 1.79
RACK1-232ENST00000514318 TIAM1Q13009 1591 aa26.2■■□□□ 1.78
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RACK1-232ENST00000514318 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RACK1-232ENST00000514318 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.19■■□□□ 1.78
RACK1-232ENST00000514318 NPATQ14207 1427 aa26.18■■□□□ 1.78
RACK1-232ENST00000514318 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.17■■□□□ 1.78
RACK1-232ENST00000514318 A2MP01023 1474 aa26.17■■□□□ 1.78
RACK1-232ENST00000514318 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.16■■□□□ 1.78
RACK1-232ENST00000514318 NCOA1Q15788 1441 aa26.15■■□□□ 1.78
RACK1-232ENST00000514318 ZMYM3Q14202 1370 aa26.13■■□□□ 1.77
RACK1-232ENST00000514318 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RACK1-232ENST00000514318 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.11■■□□□ 1.77
RACK1-232ENST00000514318 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.11■■□□□ 1.77
RACK1-232ENST00000514318 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.1■■□□□ 1.77
RACK1-232ENST00000514318 MBD5Q9P267 1494 aa26.1■■□□□ 1.77
RACK1-232ENST00000514318 CEP162Q5TB80 1403 aa26.08■■□□□ 1.77
RACK1-232ENST00000514318 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
RACK1-232ENST00000514318 PTPRKQ15262 1439 aa26.05■■□□□ 1.76
RACK1-232ENST00000514318 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
RACK1-232ENST00000514318 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.03■■□□□ 1.76
RACK1-232ENST00000514318 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
RACK1-232ENST00000514318 GGT6Q6P531 493 aa26■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 PLA2R1Q13018 1463 aa25.99■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.98■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 NCOA2Q15596 1464 aa25.98■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.97■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.96■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
RACK1-232ENST00000514318 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.94■■□□□ 1.74
RACK1-232ENST00000514318 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.92■■□□□ 1.74
RACK1-232ENST00000514318 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RACK1-232ENST00000514318 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.9■■□□□ 1.74
RACK1-232ENST00000514318 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.9■■□□□ 1.74
RACK1-232ENST00000514318 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.89■■□□□ 1.74
RACK1-232ENST00000514318 PKD2Q13563 968 aa25.89■■□□□ 1.74
RACK1-232ENST00000514318 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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