RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.88■■■■□ 3.01
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.8■■■■□ 3
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 FMN1Q68DA7 1419 aa33.69■■■□□ 2.98
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.56■■■□□ 2.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PTPRTO14522 1441 aa33.53■■■□□ 2.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.53■■■□□ 2.96
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AGLP35573 1532 aa33.53■■■□□ 2.96
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.48■■■□□ 2.95
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 C3P01024 1663 aa33.47■■■□□ 2.95
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.47■■■□□ 2.95
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.42■■■□□ 2.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCC1P33527 1531 aa33.4■■■□□ 2.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SOCS7O14512 581 aa33.4■■■□□ 2.94
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PREX2Q70Z35 1606 aa33.39■■■□□ 2.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.37■■■□□ 2.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.35■■■□□ 2.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.35■■■□□ 2.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NCOA1Q15788 1441 aa33.35■■■□□ 2.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.35■■■□□ 2.93
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.33■■■□□ 2.93
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATP7AQ04656 1500 aa33.03■■■□□ 2.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 A2MP01023 1474 aa33.01■■■□□ 2.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33■■■□□ 2.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33■■■□□ 2.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.99■■■□□ 2.87
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CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.93■■■□□ 2.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GGT6Q6P531 493 aa32.89■■■□□ 2.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.86■■■□□ 2.85
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.85■■■□□ 2.85
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A2ML1A8K2U0 1454 aa32.85■■■□□ 2.85
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MBD5Q9P267 1494 aa32.85■■■□□ 2.85
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.82■■■□□ 2.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TIAM1Q13009 1591 aa32.74■■■□□ 2.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.74■■■□□ 2.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.73■■■□□ 2.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CPS1P31327 1500 aa32.72■■■□□ 2.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.7■■■□□ 2.83
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